
Outils mis à disposition par les plateformes IFB
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3SRP Pipeline
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Transcriptomique (RNA-seq)
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
ACD Tools 2.0
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Biostatistiques
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
ACNUC
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
- Données
- Bases de données et systèmes d’informations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
ActivCollector
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Aucun des termes ci-dessus ne convient
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
ADE-4
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Biostatistiques
- Analyses multivariées
- Ecologie
- Ecologie microbienne
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
AGMIAL
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Génomique (DNA-seq)
- Analyse de génomes
- Annotation structurale et fonctionnelle des génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Ant-Motifs
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Bioinformatique structurale
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Askomics
5 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Intégration de données hétérogènes
- Représentation des connaissances
- Ontologies
- Web sémantique
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Aureme
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Intégration de données hétérogènes
- Biologie des systèmes
- Modélisation des réseaux métaboliques
- Analyse des réseaux métaboliques
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Autograph
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Prédiction d'homologie/orthologie
- Génomique comparative
- Comparaison des génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
BCSearch
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Analyse des structures, recherche d'homologues et de motifs structuraux
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
BioMAJ
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Données
- Gestion et transfert de données
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
BioMAJ2Galaxy
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Gestion et transfert de données
- Bases de données et systèmes d’informations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
BioNJ
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Evolution et phylogénie
- Evolution moléculaire
- Gènes et génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
BioShaDock
6 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
- Outils
- Intégration d'outils
- Environnements de calcul
- Cluster
- Cloud
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Cadbiom
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Biologie des systèmes
- Modélisation des réseaux de régulation
- Modélisation des systèmes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Carnac
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Caspo
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Biologie des systèmes
- Modélisation des systèmes
- Systèmes dynamiques
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
CesGO
6 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
- Intégration d'outils
- Interfaces, portails web
- Intégration de données
- Gestion et transfert de données
- Bases de données et systèmes d’informations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Clust&See
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Biologie des systèmes
- Fonctionnement des systèmes biologiques complexes
- Analyse et modélisation multi-échelle
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
CompPhy
5 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Evolution et phylogénie
- Evolution moléculaire
- Gènes et génomes
- Phylogénomique
- Super-arbres et réconciliations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
CRAC
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
CRAC
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Transcriptomique (RNA-seq)
- Analyse différentielle de l’expression des gènes
- Analyses de transcrits et transcrits variants
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
DEPIB
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Transcriptomique (RNA-seq)
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
DiNAMO
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
DroPNet
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioimagerie
- Protéomique
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
e-BGO
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Interfaces, portails web
- Bases de données et systèmes d’informations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
ESPript/ENDscript
5 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Alignement (multiple) de séquences
- Recherche de motifs
- Bioinformatique structurale
- Analyse des structures, recherche d'homologues et de motifs structuraux
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
FastME
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Evolution et phylogénie
- Evolution moléculaire
- Gènes et génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
fpocket
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Prédictions des propriétés structurales
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Frog2
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Prédictions des propriétés structurales
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
GalaxEast
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Galaxy@CBiB
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Analyse de séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
GATB
10 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Méthodologie
- Assemblage de génomes et transcriptomes
- Alignements de lectures sur des génomes
- Analyse de variants
- Exomes
- Génomes complets
- Métagénomique, métatranscriptomique
- Analyse de séquences
- Algorithmique des séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Geno3D@
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Analyse des structures, recherche d'homologues et de motifs structuraux
- Prédictions des propriétés structurales
- Modélisation comparative et de novo de structures
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
GIGWA
6 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Génomique (DNA-seq)
- Analyse de variants
- Intégration d'outils
- Interopérabilité
- Interfaces, portails web
- Bases de données et systèmes d’informations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
GO-Docker
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
- Environnements de calcul
- Cluster
- Cloud
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
GO2Pub
6 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Intégration de données hétérogènes
- Ontologies
- Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
- Données
- Intégration de données
- Bases de données et systèmes d’informations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
GoArrays
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Hex
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Prédictions des propriétés structurales
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
HexServer
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Prédictions des propriétés structurales
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
HHalign-Kbest
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Modélisation comparative et de novo de structures
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
HiSpOD
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Génomique : Puces
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Integron Finder
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Annotation de séquences
- Recherche de motifs
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
InterEvDock2
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Modélisation comparative et de novo de structures
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
KASpOD
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Génomique : Puces
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Kpax
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse des structures, recherche d'homologues et de motifs structuraux
- Modélisation comparative et de novo de structures
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
leBiBI
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Métagénomique, métatranscriptomique
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Logol
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Recherche de motifs
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
LoRDEC
5 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Méthodologie
- Alignements de lectures sur des génomes
- Génomique (DNA-seq)
- Transcriptomique (RNA-seq)
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
LSD
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Datation des spéciations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
macsyfinder
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Annotation de séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MEMHDX
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Biostatistiques
- Interfaces, portails web
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MICADo
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Méthodologie
- Analyse de variants
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MicroAnnot
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MicroScope
33 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Alignements de lectures sur des génomes
- Génomique (DNA-seq)
- Analyse de génomes
- Annotation structurale et fonctionnelle des génomes
- Transcriptomique (RNA-seq)
- Analyse différentielle de l’expression des gènes
- Analyse de variants
- Génomes complets
- Métagénomique, métatranscriptomique
- Analyse de séquences
- Algorithmique des séquences
- Alignement (multiple) de séquences
- Annotation de séquences
- Recherche de motifs
- Prédiction d'homologie/orthologie
- Biologie des systèmes
- Modélisation des réseaux métaboliques
- Outils
- Intégration d'outils
- Interopérabilité
- Interfaces, portails web
- Développement de workflows
- Données
- Intégration de données
- Gestion et transfert de données
- Bases de données et systèmes d’informations
- Environnements de calcul
- Cluster
- Parallélisation
- Génomique comparative
- Comparaison des génomes
- Comparaison des voies fonctionnelles et régulatrices
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
microSysMics
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Métagénomique, métatranscriptomique
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Minia
5 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Méthodologie
- Assemblage de génomes et transcriptomes
- Analyse de séquences
- Algorithmique des séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MIX
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Méthodologie
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Mobyle
9 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
- Outils
- Intégration d'outils
- Interopérabilité
- Interfaces, portails web
- Données
- Intégration de données
- Environnements de calcul
- Cluster
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MPscan
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Méthodologie
- Alignements de lectures sur des génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MSDA
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Protéomique
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
MTiAutoDock/MTiOpenScreen
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Criblage virtuel
- Librairies de petits composés chimiques, 2D/3D, ADME/tox
- Criblage basé sur la structure
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
NGS-QC Generator
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de données de séquençage NGS
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
NPS@
8 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Algorithmique des séquences
- Alignement (multiple) de séquences
- Annotation de séquences
- Recherche de motifs
- Prédiction d'homologie/orthologie
- Bioinformatique structurale
- Prédictions des propriétés structurales
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Nucbase
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Aucun des termes ci-dessus ne convient
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
NucleusJ
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Aucun des termes ci-dessus ne convient
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
OCG
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Fonctionnement des systèmes biologiques complexes
- Analyse et modélisation multi-échelle
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
ORDO
13 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Apprentissage automatique
- Extraction de connaissances
- Intégration de données hétérogènes
- Représentation des connaissances
- Ontologies
- Web sémantique
- Curation de collections de données
- Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
- Outils
- Intégration d'outils
- Données
- Intégration de données
- Bases de données et systèmes d’informations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
OrthoInspector
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PANAM
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Aucun des termes ci-dessus ne convient
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PanGeneHome
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Evolution et phylogénie
- Génomique comparative
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PEP-FOLD
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Bioinformatique structurale
- Modélisation comparative et de novo de structures
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PepPSY
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Prédiction d'homologie/orthologie
- Comparaison des voies fonctionnelles et régulatrices
- Protéogénomique
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PepTeam
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Algorithmique des séquences
- Recherche de motifs
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PhylArray
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Aucun des termes ci-dessus ne convient
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
phylogeny.fr
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Evolution et phylogénie
- Evolution moléculaire
- Gènes et génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Phylogeny.fr/ Blast-Explorer
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Evolution et phylogénie
- Génomique comparative
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PhyML
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Evolution et phylogénie
- Evolution moléculaire
- Gènes et génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PhySIC_IST
3 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Evolution et phylogénie
- Phylogénomique
- Super-arbres et réconciliations
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
PipeAlign
1 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
proteINSIDE
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Génomique comparative
- Protéomique
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
Protomata
4 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Analyse de séquences
- Alignement (multiple) de séquences
- Recherche de motifs
- Prédiction d'homologie/orthologie
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -
QOD
2 Mot(s)-clef(s) associé(s)- Génomique comparative
- Comparaison des génomes
- Valeur non renseignée
- Valeur non renseignée
Valeur non renseignéeValeur non renseignéeValeur non renseignée -