
Accès aux données
- via le portail : https://urgi.versailles.inra.fr/gnpis
- par catégorie https://urgi.versailles.inra.fr/Data
Données en accès authentifié dans le cadre de projets en collaboration avec la plateforme avant publication.
GnpIS est un système d’information modulaire interopérable, multi-espèces (plantes et champignons), permettant le stockage et la mise à disposition de données de génomique et de génétique : annotations de génome, cartographie physiques et génétiques (marqueurs, QTL), polymorphismes de séquence issues de reséquençage et de génotypage, génétique d’association entre marqueurs et caractères phénotypiques (GWAS), phénotypage lié à l’environnement (GxE), ressources génétiques (données patrimoniales INRA venant pour certaines d’entre elles des centres de ressources biologiques).
Steinbach D, Alaux M, Amselem J, Choisne N, Durand S, Flores R, Keliet AO, Kimmel E, Lapalu N, Luyten I et al: GnpIS: an information system to integrate genetic and genomic data from plants and fungi. Database : the journal of biological databases and curation 2013, DOI: 10.1093/database/bat058
