
ABiMS
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Adresse postale
Structure(s) :
Unité :
Website
ABiMSResponsable(s) scientifique
Responsable(s) opérationnel
Certificat(s)
- ISO 9001
- Label IBiSA
Type d'infrastructure
Capacité de stockage
Ferme de calcul
Heure de CPU
Outils bioinformatiques
Nombre d'utilisateurs
Description des serveurs
- 2 serveurs BDD (MysQL + PostreSQL)
- 1 serveur GPU
- 1 serveur R
- 10 serveurs WEB
- 3 serveurs Galaxy pour la production (NGS, Metabolomics et Public)
- 1 serveur de développement Galaxy
- 60 nœuds de calculs
- 1 serveur maître
- 4 serveurs NFS
Condition d'accès
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Visites uniques : 400 an
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Visites uniques : 100 an
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Visites uniques : Non renseignées
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MicRhoDE workflowDescriptionMicRhoDE workflow: places query sequences into MicRhoDE tree (type-1 rhodopsin phylogeny). [webpage] Conditions d'accèshttp://webtools.sb-roscoff.fr : Galaxy instance that host tools developped at the Station Biologique de Roscoff in collaboration with ABiMS (no account) |
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Visites uniques : Non renseignées
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WiseScaffolderDescriptionWiseScaffolder: genome scaffolding of pre-assembled contigs using mate-pair data. [webpage] Conditions d'accèshttp://webtools.sb-roscoff.fr : Galaxy instance that host tools developped at the Station Biologique de Roscoff in collaboration with ABiMS (no account) |
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Visites uniques : Non renseignées
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HECTARDescriptionHectar: Predict subcellular targeting for heterokont proteins. Conditions d'accèshttp://webtools.sb-roscoff.fr : Galaxy instance that host tools developped at the Station Biologique de Roscoff in collaboration with ABiMS (no account). |
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Visites uniques : Non renseignées
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JBrowse / WebApollo browsersDescriptionGenome browser sfor marine model organsims Conditions d'accès |
Domaines d'activité
- Environnement
- Biologie
- Agro-alimentaire
Description des expertises
ABiMS works with research team within the framework of scientific collaboration formalised as project.
ABiMS provide differents services :
- A scientific computing environment (Infrastructure As A Service - IAAS)
- Advice and expertise in 'omic data analysis
- Software engineering (information system, databases, ...)
- User support and training
Mots clés:
- Analyse de données de séquençage NGS
- Méthodologie
- Assemblage de génomes et transcriptomes
- Alignements de lectures sur des génomes
- Génomique (DNA-seq)
- Analyse de génomes
- Annotation structurale et fonctionnelle des génomes
- Transcriptomique (RNA-seq)
- Analyse différentielle de l’expression des gènes
- Analyses de transcrits et transcrits variants
- Analyse de variants
- Analyse de la régulation de l’expression des gènes
- Métagénomique, métatranscriptomique
- Curation de collections de données
- Outils
- Intégration d'outils
- Interopérabilité
- Interfaces, portails web
- Développement de workflows
- Données
- Intégration de données
- Bases de données et systèmes d’informations
- Environnements de calcul
- Cluster
- GPU
- Evolution moléculaire
- Gènes et génomes
- Détection de sélection
- Génomique comparative
- Comparaison des génomes
- Génomique : Puces
- Biopuces ADN
- Fonctionelles
- Biopuces ARN
- Expression
- Métabolomique et fluxomique
Formation professionnelle
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : 261 personnes / an
Temps de formation : Non renseigné
Pas de nouvelle session prévue
Formation ABiMSDescriptionL'offre de formation repose sur des modules de formation d'initiation aux environnements (Linux, Cluster, etc.), d'utilisation des outils (Galaxy, etc.) et langages (PERL, R, etc.), et de compréhension des méthodes (RNA-seq, Analyses statistiques, etc.). ABiMS est également en mesure de proposer des formations à façon pour des communautés (e.g. Métabolomique) ou des projets (École thématique).
Conditions d'accèsOuvert à tous avec facturation |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 1 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue
ClusterDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 1 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue
Linux initiationDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 1 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue
Linux avancéDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 1 jour(s) / an
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R initiationDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 1 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue
R avancéDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 1 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue
Galaxy initiationDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 2 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue
Galaxy : RNAseq de novo/avec référence & cleaningDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Aucun site web renseignéPersonnes formées : Non renseigné
Temps de formation : 2 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue
Galaxy : Initiation à la phylogénieDescriptionNon renseignéConditions d'accèsNon renseigné |
![]() Personnes formées : 18 personnes / an
Temps de formation : 4 jour(s) / an
Prochaine session : 14-05-2018
Analyse de données metabarcodingDescriptionNous avons le plaisir de vous annoncer la tenue d'une formation sur l'analyse de données metabarcoding en mai 2018.
Celle-ci vous proposera : - une formation complète à l'outil FROGS sous Galaxy Cette semaine thématique est co-organisée entre la cellule bioinformatique de l’ifremer à Brest, la plateforme MIGALE de Jouy et la plate-forme ABiMS de Roscoff qui accueillera la formation. Retrouver les détails du programme ici : http://tiny.ifremer.fr/formation-metabarcoding-2018 Si cette formation vous intéresse, merci de bien vouloir compléter le formulaire d'inscription (disponible dans le lien ci-dessus). ---------------------------------------- We are pleased to announce a training on metabarcoding data analysis in May 2018. This one will propose to you: - complete training in the FROGS tool under Galaxy This theme week is co-organized with the IFREMER bioinformatic team (Brest) , the Migale bioinformatic platform(Jouy en Josas) and the ABiMS (Roscoff) bioinformatic platform and would take place in Roscoff.. Find the details of the program here:
http://tiny.ifremer.fr/formation-metabarcoding-2018 If you are interested in this training, please complete the registration form (see link above). Trainning will be in French with slides in English. Conditions d'accèsDates et lieu
Public viséDoctorants, ITA, chercheurs, enseignants et ingénieurs impliqués dans des projets concrets d’analyse de données de metabarcoding. Pré-requisAvoir une connaissance de l'environnement Galaxy et un projet d'analyse de données de metabarcoding. Nombre de participants attendus18 participants. Etant donné le nombre limité de places pour cette formation, une sélection des participants sera réalisée dans le cas où nous aurions reçu plus de 18 candidatures. Frais d'inscription600€ HT (tarif unique) Ces frais d'inscription comprennent les déjeuners et diners qui seront pris au restaurant Gulf Stream à Roscoff. |
Publications internes
Workflow4Metabolomics: A collaborative research infrastructure forin computational metabolomics Franck Giacomoni,†, Gildas Le Corguillé,†, Misharl Monsoor, Marion Landi, Pierre Pericard, Mélanie Pétéra, Christophe Duperier, Marie Tremblay-Franco, Jean-François Martin, Daniel Jacob, Sophie Goulitquer, Etienne A. Thévenot, Christophe Caron. 2014, Bioinformatics, doi: 10.1093/bioinformatics/btu813
Publications externes
Dupont, Samuel; Corre, Erwan; Li, Yanyan; Vacelet, Jean; Bourguet-Kondracki, Marie-Lise. 2013. First insights into the microbiome of a carnivorous sponge. FEMS Microbiol Ecol. 2013 Jul 12. doi: 10.1111/1574-6941.12178.
G. Carrier, M. Garnier, L. Le Cunff, G. Bougaran, I. Probert, C. de Vargas, E. Corre, J.-P. Cadoret, and B. Saint-Jean, “Comparative Transcriptome of Wild Type and Selected Strains of the Microalgae Tisochrysis lutea Provides Insights into the Genetic Basis, Lipid Metabolism and the Life Cycle.,” PLoS ONE, vol. 9, no. 1, p. e86889, 2014.
Robert, M., Zatylny-Gaudin, C., Fournier, V., Corre, E., Le Corguillé, G., Bernay, B., & Henry, J. (2014). Transcriptomic and peptidomic analysis of protein hydrolysates from the white shrimp (L. vannamei). Journal of Biotechnology, 186C, 30–37. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.06.020
Emmanuelle Pales Espinosa, Erwan Corre and Bassem Allam. 2014. Pallial mucus of the oyster Crassostrea virginica regulates the expression of putative virulence genes of its pathogen Perkinsus marinus. International Journal for Parasitology, 44(5), 305–317. doi:10.1016/j.ijpara.2014.01.006
Céline Zatylny-Gaudin Valerie Cornet; Joël Henry; Erwan Corre; Gildas Le Corguille; Bruno Zanuttin. 2014. Dual role of the cuttlefish salivary proteome in defense and predation ». Journal of Proteomics, 108, 209–222. doi:10.1016/j.jprot.2014.05.019.
Marie Robert, Céline Zatylny-Gaudin,Vincent Fournier, Erwan Corre, Gildas Le Corguillé ,Benoît Bernay, Joel Henry. Molecular and functional characterization of peptide fractions of a Tilapia (Oreochromis niloticus) by-product hydrolysate. Process Biochemistry, Volume 50, Issue 3, March 2015, Pages 487-492
V. Cornet, B.Houyvet, J.Henry, , B.Bernay, E.Corre, G. Le Corguillé, C. Zatylny-Gaudin. The Toll/NF<kappa> B pathway in cuttlefish symbiotic accessory nidamental gland. Developmental & Comparative Immunology. Volume 53, Issue 1, November 2015, Pages 42–46
Cornet V, Henry J, Goux D, Duval E, Bernay B, Le Corguillé G, et al. (2015) How Egg Case Proteins Can Protect Cuttlefish Offspring? PLoS One 10(7): e0132836. doi:10.1371/journal.pone.0132836
Barbara Gasse; Xi Liu; Erwan Corre; Jean-Yves Sire. Amelotin gene structure and expression during enamel formation in the opossum Monodelphis domestica. PLoS One. 2015; 10(7): e0133314.
Zatylny-Gaudin, Celine; Cornet, Valérie; Leduc, Alexandre; Zanuttini, Bruno; Corre, Erwan; Lecorguillé, Gildas; Bernay, Benoît; Garderes, Johan; Kraut, Alexandra; Couté, Yohann; Henry, Joël. Neuropeptidome of the cephalopod Sepia officinalis: identification, tissue mapping and expression pattern of neurotransmitters and neurohormones during egg-laying. Journal of Proteome Research. Decembre 2015 DOI: 10.1021/acs.jproteome.5b00463
K. Wang, C. Del Castillo, E. Corre, E. Pales-Espinosa, and B. Allam, “Clam focal and systemic immune responses to QPX infection revealed by RNA-seq technology.,” BMC Genomics, vol. 17, no. 1, p. 146, 2016
Publications avec le laboratoire d'hébergement
Cátia Monteiro and Sandra Heinrich and Inka Bartsch and Klaus Valentin and Erwan Corre and Jonas Collén and Lars Harms and Gernot Glöckner and Kai Bischof; Temperature Modulates Sex-Biased Gene Expression in the Gametophytes of the Kelp Saccharina latissima, Frontiers in Marine Science 2019; 6 doi: 10.3389/fmars.2019.00769.
Elham Karimi and Enora Geslain and Hetty KleinJan and Gwenn Tanguy and Erwan Legeay and Erwan Corre and Simon M Dittami; Genome Sequences of 72 Bacterial Strains Isolated from Ectocarpus subulatus: A Resource for Algal Microbiology, Genome Biology and Evolution 2019; 12(1) doi: 10.1093/gbe/evz278.
Nègre and Aite and Belcour and Frioux and Brillet-Guéguen and Liu and Bordron and Godfroy and Lipinska and Leblanc and Siegel and Dittami and Corre and Markov; Genome–Scale Metabolic Networks Shed Light on the Carotenoid Biosynthesis Pathway in the Brown Algae Saccharina japonica and Cladosiphon okamuranus, Antioxidants 2019; 8(11) doi: 10.3390/antiox8110564.
Annie Lebreton and Erwan Corre and Jean-Luc Jany and Loraine Brillet-Guéguen and Carlos Pèrez-Arques and Victoriano Garre and Misharl Monsoor and Robert Debuchy and Christophe Le Meur and Emmanuel Coton and Georges Barbier and Laurence Meslet-Cladière; Comparative genomics applied to Mucor species with different lifestyles, BMC Genomics 2020; 21(1) doi: 10.1186/s12864-019-6256-2.
Cátia Marina Machado Monteiro and Huiru Li and Kai Bischof and Inka Bartsch and Klaus Ulrich Valentin and Erwan Corre and Jonas Collén and Lars Harms and Gernot Glöckner and Sandra Heinrich; Is geographical variation driving the transcriptomic responses to multiple stressors in the kelp Saccharina latissima?, BMC Plant Biology 2019; 19(1) doi: 10.1186/s12870-019-2124-0.
Marjorie Couton and Thierry Comtet and Sabrina Le Cam and Erwan Corre and Frédérique Viard; Metabarcoding on planktonic larval stages: an efficient approach for detecting and investigating life cycle dynamics of benthic aliens, Management of Biological Invasions 2019; 10(4) doi: 10.3391/mbi.2019.10.4.06.
Alexandra Rahmani and Erwan Corre and Gaëlle Richard and Adeline Bidault and Christophe Lambert and Louisi Oliveira and Cristiane Thompson and Fabiano Thompson and Vianney Pichereau and Christine Paillard; Transcriptomic analysis of clam extrapallial fluids reveals immunity and cytoskeleton alterations in the first week of Brown Ring Disease development, Fish & Shellfish Immunology 2019; 93 doi: 10.1016/j.fsi.2019.08.025.
Huiru Li and Cátia Monteiro and Sandra Heinrich and Inka Bartsch and Klaus Valentin and Lars Harms and Gernot Glöckner and Erwan Corre and Kai Bischof; Responses of the kelp Saccharina latissima (Phaeophyceae) to the warming Arctic: from physiology to transcriptomics, Physiologia Plantarum 2019; 168(1) doi: 10.1111/ppl.13009.
François Thomas and Erwan Corre and Aurélie Cébron; Stable isotope probing and metagenomics highlight the effect of plants on uncultured phenanthrene-degrading bacterial consortium in polluted soil, The ISME Journal 2019; 13(7) doi: 10.1038/s41396-019-0394-z.
Laure Arsenieff and Nathalie Simon and Fabienne Rigaut-Jalabert and Florence Le Gall and Samuel Chaffron and Erwan Corre and Emmanuelle Com and Estelle Bigeard and Anne-Claire Baudoux; First Viruses Infecting the Marine Diatom Guinardia delicatula, Frontiers in Microbiology 2019; 9 doi: 10.3389/fmicb.2018.03235.
I. Rombouts and N. Simon and A. Aubert and T. Cariou and E. Feunteun and L. Guérin and M. Hoebeke and A. McQuatters-Gollop and F. Rigaut-Jalabert and L.F. Artigas; Changes in marine phytoplankton diversity: Assessment under the Marine Strategy Framework Directive, Ecological Indicators 2019; 102 doi: 10.1016/j.ecolind.2019.02.009.
Mohsen Kayal and Hannah Lewis and Jane Ballard and Ehsan Kayal; Humanity and the 21 st century's resource gauntlet: a commentary on Ripple et al.'s article “World scientists' warning to humanity: a second notice”, Rethinking Ecology 2019; 4 doi: 10.3897/rethinkingecology.4.32116.
Aki Ohdera and Cheryl L Ames and Rebecca B Dikow and Ehsan Kayal and Marta Chiodin and Ben Busby and Sean La and Stacy Pirro and Allen G Collins and Mónica Medina and Joseph F Ryan; Box, stalked, and upside-down? Draft genomes from diverse jellyfish (Cnidaria, Acraspeda) lineages: Alatina alata (Cubozoa), Calvadosia cruxmelitensis (Staurozoa), and Cassiopea xamachana (Scyphozoa), GigaScience 2019; 8(7) doi: 10.1093/gigascience/giz069.
Simon M Dittami and Enrique Arboleda and Jean-Christophe Auguet and Arite Bigalke and Enora Briand and Paco Cardenas and Ulisse Cardini and Johan Decelle and Aschwin H Engelen and Damien Eveillard and Claire M.M. Gachon and Sarah M Griffiths and Tilmann Harder and Ehsan Kayal and Elena Kazamia and François H Lallier and Mónica Medina and Ezequiel Marzinelli and Teresa Morganti and Laura Núñez Pons and Soizic Prado and José Pintado and Mahasweta Saha and Marc-André Selosse and Derek Skillings and Willem Stock and Shinichi Sunagawa and Eve Toulza and Alexey Vorobev and Catherine Leblanc and Fabrice Not; A community perspective on the concept of marine holobionts: current status, challenges, and future directions, PeerJ 2019; doi: 10.7287/peerj.preprints.27519v3.
Toullec J-Y, Corre E, Bernay B, Thorne MAS, Cascella K, et al. (2013) Transcriptome and Peptidome Characterisation of the Main Neuropeptides and Peptidic Hormones of a Euphausiid: The Ice Krill, Euphausia crystallorophias. PLoS ONE 8(8): e71609. doi:10.1371/journal.pone.0071609
Janouškovec J, Liu SL, Martone PT, Carré W, Leblanc C, Collén J, Keeling PJ. 2013.Evolution of red algal plastid genomes: ancient architectures, introns, horizontal gene transfer, and taxonomic utility of plastid markers.PLoS One. 2013;8(3):e59001. doi: 10.1371/journal.pone.0059001. Epub 2013 Mar 25.
Collén J., Porcel B., Carré W., Ball S., Chaparro C., Tonon T., Barbeyron T., Michel G., Noel B., Valentin K., Elias M., Artiguenave F., Arun A., Aury J.M., Barbosa-Neto J.F., Bothwell J.H., Bouget F.Y., Brillet L., Cabello-Hurtado F., Capella-Gutíerrez S., Charrier B., Cladière L., Cock J.M., Coelho S.M., Colleoni C., Czjzek M., Da Silva C., Delage L., Denoeud F., Deschamps P., Dittami S.M., Gabaldón T., Gachon C.M., Groisillier A., Hervé C., Jabbari K., Katinka M., Kloareg B., Kowalczyk N., Labadie K., Leblanc C., Lopez P.J., McLachlan D., Meslet-Cladiere L., Moustafa A., Nehr Z., Nyvall Collén P., Panaud O., Partensky F., Poulain J., Rensing S.A., Rousvoal S., Samson G., Symeonidi A., Weissenbach J., Zambounis A., Wincker P., Boyen C. 2013, Genome structure and metabolic features in the red seaweed Chondrus crispus shed light on evolution of the Archaeplastida. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Mar 26;110(13):5247-52. doi: 10.1073/pnas.1221259110.
Sophia Ahmed, J Mark Cock, Eugenie Pessia, Remy Luthringer, Alexandre Cormier, Marine Robuchon, Lieven Sterck, Akira F Peters, Simon M Dittami, Erwan Corre, Myriam Valero, Jean-Marc Aury, Denis Roze, Yves Van de Peer, John Bothwell, Gabriel A B Marais, Susana M Coelho (2014). A Haploid System of Sex Determination in the Brown Alga Ectocarpus sp. Current Biology : CB, 24(17), 1945–1957.
Godard, B. G., Coolen, M., Le Panse, S., Gombault, A., Ferreiro-Galve, S., Laguerre, L., Ronan Lagadec, Patrick Wincker, Julie Poulain, Corinne Da Silva, Shigehiro Kuraku, Wilfrid Carre, Agnes Boutet and Sylvie Mazan. (2014). Mechanisms of endoderm formation in a cartilaginous fish reveal ancestral and homoplastic traits in jawed vertebrates. Biology Open, 3(11), 1098–1107. doi:10.1242/bio.20148037
Kevin Cascella, Didier Jollivet, Claire Papot, Nelly Léger, Erwan Corre, Juliette Ravaux, Melody S. Clark and Jean-Yves Toullec.2014 Diversification, evolution and sub-functionalization of 70kDa heat-shock proteins in two sister species of Antarctic krill: Differences in thermal habitats, responses and implications under climate change. PLoS One. 10(4):e0121642
Gregory K Farrant, Mark Hoebeke, Frédéric Partensky, Gwendoline Andres, Erwan Corre and Laurence Garczarek. WiseScaffolder: an algorithm for the semi-automatic scaffolding of Next Generation Sequencing data. BMC Bioinformatics. 2015; 16(1): 281. doi: 10.1186/s12859-015-0705-y
Simon M. Dittami, Laëtitia Duboscq-Bidot, Morgan Perennou, Angélique Gobet, Erwan Corre, Catherine Boyen, Thierry Tonon. Host-microbe interactions as a driver of brown algal acclimation to salinity gradients. The ISME Journal , (26 June 2015) | doi:10.1038/ismej.2015.104
Lipinska A, Cormier A, Luthringer R, Peters AF, Corre E, Gachon CMM, Cock JM, Coelho SM. 2014. Sexual dimorphism and the evolution of sex-biased gene expression in the brown alga Ectocarpus. Mol Biol Evol. 2015 Jun;32(6):1581-97
Dominique Boeuf; Stephane Audic; Loraine Brillet-Gueguen; Christophe Caron; Christian Jeanthon. 2015. MicRhoDE: a curated database for the analysis of microbial rhodopsin diversity and evolution Database 2015; doi: 10.1093/database/bav080
James E. Tarver, Alexandre Cormier, Natalia Pinzón, Richard S. Taylor, Wilfrid Carré, Martina Strittmatter, Hervé Seitz, Susana M. Coelho and J. Mark Cock. microRNAs and the evolution of complex multicellularity: identification of a large, diverse complement of microRNAs in the brown alga Ectocarpus. Nucl. Acids Res. (27 July 2015) 43 (13): 6384-6398.; doi: 10.1093/nar/gkv578
Sergio Balzano, Erwan Corre, Johan Decelle, Roberto Sierra, Patrick Wincker, Corinne Da Silva, Julie Poulain, Jan Pawlowski, Fabrice Not. Transcriptome analyses to investigate symbiotic relationships between marine protists. Front Microbiol. 2015 Mar 17;6:98, section Microbial Physiology and Metabolism
Répartition des utilisateurs
Description de la répartition :
Projets propres de la plateforme
Aucun (ou non renseigné)
Collaborations
Projets d'ANR
- PIA IdealG 2011-2019
- PIA OCEANOMICS 2012-2019
- PIA EMBRC-France 2011-2019
- ANR IMPEKAB 2015-2018
- ANR HAPAR 2014-2019
- ANR SAMOSA 2014-2017
- ANR CALYpSO 2016-2017
- ANR VIBRIOGEN 2011-2015
- ANR ISOBAR 2014-2015
- ANR SEXSEAWEED 2013-2016
Projets européens et internationaux
- ERC StG SEXSEA (susana COELHO) H2020 2015 : Origin and evolution of the sexes and reproductive systems: novel insights from a distant eukaryotic lineage
- INFRADEV-4 EMBRIC (European Marine Biological Research Infrastructure Cluster to promote the Blue Bioeconomy)
- INTEREG : ChanneLIS : Channel Library and Information Services and is a project that will bring closer together library resources from SBR and MBA, on both sides of the Channel
- INTEREG : MARINEXUS our shared seas - Mechanisms of ecosystem change in the Western Channel
- MaCuMBA, Marine Microorganisms: Cultivation Methods for Improving their Biotechnological Applications
- EMBRC : ESFRI European Research Infrastructure – European Marine Biological Resource Centre
- ASSEMBLE : Association of European Marine Biological Laboratories
Projets avec des industriels
Koriplast2 : programme de recherche collaboratif KoriPlast2 mené par Korilog, l’INRIA de Rennes et ABiMS , financé par la Région Bretagne et accompagné par le CRITT Santé Bretagne.
Projets de collaboration non financés par un organisme extérieur
Prestations de service non financés par un organisme extérieur
Animations
Mise en place de formation : Galaxy4Bioinformatics
(co)organisation des écoles/actions nationales AVIESAN, Galaxy4Bioinformatics, Workflow4Metabolomics