Formations passées

Workshop CNRS Single-Cell 2020

Ecole thématique CNRS Single-Cell // Transcriptomique et épigénomique en cellule unique: théorie et pratique (sincellTE)

Du 22-03-2020 au 27-03-2020 à Station Biologique Roscoff.

Formation MicroScope 2020 session 1

Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform

Du 16-03-2020 au 20-03-2020 à Université Evry Paris-Saclay.

DIPLÔME UNIVERSITAIRE EN BIOINFORMATIQUE INTÉGRATIVE : DU-BII 2020

Du 02-03-2020 au 19-06-2020 à Université Paris Diderot, France.

Train the Trainers 2020

ELIXIR Train-the-Trainers (TtT)

Du 10-02-2020 au 11-02-2020 à l'Ecole Normale Superieur, Biology Departement (IBENS).

W4E 2020

During this one-week course, Participants will learn how to use the W4M infrastructure to analyze their own dataset

Du 03-02-2020 au 07-02-2020 à Centre For Fine Arts (BOZAR), rue Royale n°10 to 1000 - Brussels (Belgium).

Administration avancée de HPC à destination d'administrateurs systèmes d'Afrique de l'Ouest

utilisation avancée de l'administration de HPC à destination d'administrateurs systèmes d'Afrique de l'Ouest

Du 11-01-2020 au 11-01-2020 à Université de Ouagadougou, Burkina faso.

Metabarcode

Du 02-12-2019 au 06-12-2019 à Roscoff .

Formation MicroScope 2019

Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform

Du 18-11-2019 au 22-11-2019 à Université Evry Paris-Saclay.

ELIXIR Biohackathon 2019

BioHackathon activities are driven by practical sessions where people gather, discuss, and implement ideas/projects

Du 18-11-2019 au 22-11-2019 à Paris area (berges de Seine).

Intiation aux analyses de données NGS - 2

Une formation offrant des connaissances pluridisciplinaires dans le domaine de la bioinformatique...

Du 04-11-2019 au 04-11-2019 à Montpellier, France.

8ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

Du 03-11-2019 au 08-11-2019 à la Station biologique de Roscoff.

Analyse avancée de séquences

Cette formation a pour objectif de : savoir rechercher des informations dans les banques de données, maîtriser les outils...

Du 29-10-2019 au 31-10-2019 à Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB).

Analyses NGS avec R

savoir analyser des séquences de reads NGS, déterminer les ARN messagers différentiellement exprimés et enrichir les résultats

Du 24-10-2019 au 25-10-2019 à Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB).

R introduction

Cette formation a pour objectif d' acquérir les bases pour l'utilisation du langage R.

Du 22-10-2019 au 23-10-2019 à Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB).

Intiation aux analyses de données NGS - 1

Une formation offrant des connaissances pluridisciplinaires dans le domaine de la bioinformatique...

Du 21-10-2019 au 21-10-2019 à Montpellier.

Modify and extract information from large text files

Du 15-10-2019 au 15-10-2019 à INRA Auzeville-Tolosane, France.

Phylogénie moléculaire

Introduction théorique et pratique de la phylogénie moléculaire

Du 07-10-2019 au 11-10-2019 à Montpellier.

RNASeq Analysis with Galaxy

Du 01-10-2019 au 01-10-2019 à Roscoff .

Analyse statistique de données RNA-Seq - Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio)

Se sensibiliser aux concepts et méthodes statistiques pour l'analyse de données transcriptomiques de type RNA-Seq.

Du 26-09-2019 au 27-09-2019 à Jouy en Josas.

Assemblage de transcriptome

Assemblage de novo des transcrits avec Trinity...

Du 25-09-2019 au 27-09-2019 à Montpellier.

Analyse de données métagénomiques 16S

Cette formation est dédiée à l'analyse de données de type "metabarcoding" issues de la technologie de séquençage Illumina.

Du 16-09-2019 au 18-09-2019 à Jouy en Josas.

Initiation au langage R

Apprendre les principales fonctionnalités du langage R et ses principes

Du 12-09-2019 au 13-09-2019 à Jouy en Josas, France.

Functional analysis and interpretation of proteomic data with ProteoRE

ProteoRE permet d’interpréter des données de protéomique de façon interactive, reproductible et collaborative.

Du 10-07-2019 au 11-07-2019 à Campus de Beaulieu, IFSIC, Rennes, FR. Bâtiment/Building 12D, room 102.

Formation au package R-Shiny

Du 09-07-2019 au 10-07-2019 à I. Pasteur, Paris.

Genopole Summer School 2019

Bioinformatic and Biostatistic tools in medical genomics

Du 24-06-2019 au 28-06-2019 à Châteauform' Seine Port (77).

Introduction au Langage de Programmation R

La Plateforme BiRD, avec le support du service Focal de la Faculté des Sciences et Techniques, organise une nouvelle formation.

Du 06-06-2019 au 06-06-2019 à Faculté de Pharmacie de Nantes.

Initiation à la programmation pour l’analyse de données génomiques

Du 27-05-2019 au 27-05-2019 à Lyon.

Single cell RNA-seq data analysis with R

This hands-on course covers several aspects of single cell RNA-seq data analysis, ranging from clustering and so on

Du 27-05-2019 au 29-05-2019 à CSC at Keilaranta 14, Espoo, Finland.

Introduction to R Language

Du 20-05-2019 au 20-05-2019 à CBiB.

RNaseq with Galaxy

Du 19-05-2019 au 20-05-2019 à Roscoff.

Marseille Hackathon Training Event

3-days training session / hackathon in Marseille

Du 23-04-2019 au 26-04-2019 à Faculté des science de Luminy, Marseille.

Elixir Galaxy Community - Workshop at Roscoff/France

Galaxy training and hackathon sessions

Du 23-04-2019 au 26-04-2019 à Station Biologique de Roscoff, France.

ELIXIR Software Carpentry Workshop 2019

Teaching basic lab skill for Research Computing

Du 15-04-2019 au 16-04-2019 à INSTITUT JACQUES MONOD - Université Paris Diderot/CNRS .

Analyse fonctionnelle et interprétation de données de protéomique avec ProteoRE

Mis en oeuvre des outils de la plate-forme web ProteoRE pour l'annotation des protéomes

Du 14-03-2019 au 15-03-2019 à Institut des Systèmes Complexes (ISC-PIF), 113 rue Nationale 75013 Paris.

Formations dans le cadre du Mésocentre

Du 12-03-2019 au 12-03-2019 à Campus des Cézeaux, Aubière.

WAVES Training 2019

We organize a workshop to train users to WAVES, a Web Application for Versatile Enhanced Bioinformatic Services

Du 11-03-2019 au 11-03-2019 à Lille.

Gestion de données en Python - Avancé

Du 02-03-2019 au 03-03-2019 à Roscoff.

Gestion de données avec Python : Initiation

Du 28-02-2019 au 01-03-2019 à Roscoff.

Ecole single-cell 2019

Transcriptomique et épigénomique en cellule unique: théorie et pratique (sincellTE)

Du 03-02-2019 au 08-02-2019 à Station Biologique Roscoff.

Manual curation of Transposable element annotation

URGI organizes a BYOD-style (Bring Your Own Data) training course on manual curation of transposable elements reference sequences

Du 03-02-2019 au 05-02-2019 à URGI INRA, Bat 18 Route de SaintCyr RD10, 78026 Versailles Cedex.

Diplôme Universitaire en bioinformatique intégrative 2019

L'université Paris Diderot en partenariat avec l'IFB propose un diplôme un universitaire en bioinformatique

Du 01-02-2019 au 01-02-2019 à Université Paris-Diderot.

INTRODUCTION À L'ANALYSE DE DONNÉES

Du 13-01-2019 au 07-02-2019 à Institut Pasteur.

WAVES Training

We organize a workshop to train users to WAVES, a Web Application for Versatile Enhanced Bioinformatic Services

Du 18-12-2018 au 18-12-2018 à Institut Pasteur (Paris).

7ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

Du 25-11-2018 au 30-11-2018 à Station biologique de Roscoff.

RNASeq alignment and transcripts assemblies

RNAseq analysis

Du 14-11-2018 au 15-11-2018 à Auzeville-Tolosane.

Analyse des données RNA-Seq sous l'environnement Galaxy

Du 13-11-2018 au 15-11-2018 à Lyon.

Linux/Unix

This training session has been designed to familiarize yourself with the platform resources and its organization.

Du 12-11-2018 au 12-11-2018 à Auzeville-Tolosane.

Formation au logiciel R

Formation à l'utilisation de R appliqué à la bioinformatique

Du 08-10-2018 au 10-10-2018 à Lyon.

W4E 2018

During this one-week course, participants will learn how to use the W4M infrastructure to analyze their own dataset.

Du 08-10-2018 au 12-10-2018 à Pasteur Institute - Paris.

Data analysis

Du 07-10-2018 au 11-10-2018 à Ecole Normale Supérieure.

Analyse de données NGS dédiée à la génomique végétale en Afrique de l'Ouest

Cette formation présente les technologies de séquençages et les différentes analyses possibles pour exploiter ces données.

Du 03-10-2018 au 11-10-2018 à CERAAS, Thiès (Sénégal).

Installing and Managing a High-Performance Computing (HPC) Cluster

This course ran for 5 days covering all the concepts necessary to install and manage a high-performance computing (HPC) cluster.

Du 30-09-2018 au 04-10-2018 à CERAAS, Thiès (Sénégal).

Elixir Training: Plant Genome Assembly and Annotation

The course is aimed at researchers interested in learning more about genome assembly and annotation

Du 24-09-2018 au 28-09-2018 à Cirad Montpellier.

ChIP-seq, RNA-seq et Hi-C : traitement, analyse et visualisation de données

Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq, RNA-seq et Hi=C

Du 26-06-2018 au 29-06-2018 à Montpellier.

Genopole Summer School 2018

Bioinformatic and Biostatistic tools in medical genomics

Du 25-06-2018 au 29-06-2018 à Châteauform' Seine Port (77).

Ecole thématique CNRS 2018

Transcriptomique et épigénomique en cellule unique: théorie et pratique (sincellTE)

Du 17-06-2018 au 22-06-2018 à Station Biologique Roscoff.

Integrative Bioinformatics Symposium 2018

Bring together experts in the field of bioinformatics, computer science, statistics, computational and systems biology

Du 13-06-2018 au 15-06-2018 à Rothamsted Research, Harpenden, England, United Kingdom.

Détection et annotation des éléments transposables dans les génomes eucaryotes

L'URGI organise une formation sur la détection et l'annotation des éléments transposables par les pipelines REPET.

Du 11-06-2018 au 13-06-2018 à URGI - INRA de Versailles .

RNAseq de novo assembly - Genotoul (second session)

Training course for bio-informaticians and biologists aiming at introduce analysis of sequences

Du 05-06-2018 au 05-06-2018 à Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

Anniversary RSAT/GINsim

RSAT and GINsim are reaching their 20th and 15th anniversary, respectively.

Du 16-05-2018 au 17-05-2018 à Ecole Normale Supérieure Paris.

analyse de données metabarcoding

introduire les concepts clés liés aux analyses de metabarcoding et les illustrer au moyen de cas concrets d’analyse

Du 13-05-2018 au 17-05-2018 à ROSCOFF.

Metabarcoding analyses (using FROGS in Galaxy and Phyloseq)

This course offers an introduction to metabarcoding analyses at two different levels (FROGS pipeline, PhyloSeq R package).

Du 22-04-2018 au 22-04-2018 à Centre IRD, Montpellier.

Metagenomic: amplicons and stats

Familiarization with the hardware infrastructure, biological data banks and widely used bioinformatics softwares ...

Du 09-04-2018 au 12-04-2018 à Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

ELIXIR Software Carpentry Workshop

Teaching basic lab skill for Research Computing

Du 28-03-2018 au 29-03-2018 à l'Institut Pasteur (Paris).

Train the Trainers

ELIXIR-EXCELERATE Train-the-Trainers (TtT)

Du 26-03-2018 au 27-03-2018 à l'Institut Pasteur.

Initiation to NGS Workflow Managers developed within the South Green Platform: Galaxy and TOGGLe

This course provides introduction to workfow managers to quickly develop and run their own pipelines.

Du 22-03-2018 au 22-03-2018 à Centre IRD, Montpellier.

Détection de variants à partir de données NGS

Du 18-03-2018 au 18-03-2018 à Université Montpellier 1.

Analyse de séquences

Du 18-03-2018 au 22-03-2018 à Institut Pasteur.

RNASeq analyses (using Galaxy and TOGGLe)

This course offers an introduction to RNASeq analyses using two different workflow management systems: Galaxy and TOGGLe

Du 15-03-2018 au 15-03-2018 à Centre IRD, Montpellier.

High-performance computing Course

This course provides a general introduction to High Performance Computing (HPC) using the HPC South green clusters.

Du 14-03-2018 au 14-03-2018 à Centre IRD, Montpellier.

Galaxy - Initiation

Du 14-03-2018 au 14-03-2018 à ROSCOFF.

NGS et Cancer (Canceropôle) : Analyse A-RNASeq

Du 13-03-2018 au 13-03-2018 à .

NGS et Cancer (Canceropôle) : Analyse épigénomique

Du 13-03-2018 au 13-03-2018 à .

IFSBM (UFR medecine paris sud) : Big Data

Du 13-03-2018 au 13-03-2018 à .

NGS et Cancer (Canceropôle) : Analyse DNASeq

Du 13-03-2018 au 13-03-2018 à .

Linux For Jedi

Du 12-03-2018 au 12-03-2018 à Centre IRD, Montpellier.

Linux For Dummies

Du 11-03-2018 au 11-03-2018 à Centre IRD, Montpellier.

Analyse RNA-seq sous Galaxy

Du 05-03-2018 au 05-03-2018 à Rennes.

Administration Galaxy

Du 26-02-2018 au 26-02-2018 à Mésocentre Clermont Auvergne.

Administration Galaxy

Installer, configurer, et customiser un serveur Galaxy. Avoir les bonnes pratiques d’installation et gestion d’un serveur Galaxy.

Du 26-02-2018 au 26-02-2018 à Mésocentre Clermont Auvergne.

RNAseq de novo assembly - Genotoul

Training course for bio-informaticians and biologists aiming at introduce analysis of sequences

Du 06-02-2018 au 06-02-2018 à Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

Reads alignment and small size variants calling with Galaxy

Introduction to NGS data, in particular Illumina technologies.

Du 01-02-2018 au 02-02-2018 à Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

Galaxy initiation, RNAseq, SARTools

Course for biologists aiming at learning RNAseq analysis on Galaxy environment.

Du 29-01-2018 au 31-01-2018 à Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

Formation BioMAJ

Du 17-12-2017 au 18-12-2017 à Vitry.

Introduction à la Phylogénie Moléculaire : Concepts, méthodes et interprétation

Le C3BI propose des cours pour acquérir les notions théoriques de phylogénie et maitriser les outils et logiciels.

Du 17-12-2017 au 21-12-2017 à Institut Pasteur.

From RNA-Seq data to bioinformatics analysis using Nanopore sequencers

One-day workshop dedicated to transcriptome studies using the MinION

Du 13-12-2017 au 13-12-2017 à 2 rue Gaston crémieux, Evry.

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 5/5 : Métagénomique

Formation "Métagénomique"

Du 06-12-2017 au 08-12-2017 à Université de Lille.

Formation "Plateforme MicroScope - Cours avancé"

Approfondissement des outils majeurs de la plateforme MicroScope

Du 04-12-2017 au 05-12-2017 à Evry, France.

Cluster usage

Du 03-12-2017 au 03-12-2017 à Roscoff.

MicroScope: formation avancée

Du 03-12-2017 au 04-12-2017 à Université d'Evry Val d'Essonne.

Linux advanced

Du 28-11-2017 au 28-11-2017 à Roscoff.

Linux Initiation

Du 27-11-2017 au 27-11-2017 à Roscoff.

Analyse RNA-seq de novo

Du 21-11-2017 au 23-11-2017 à Villeurbanne.

Fouille de données et analyse de données NGS avec R

Du 19-11-2017 au 22-11-2017 à CBiB.

Analyse de données RNA-seq sous l’environnement Galaxy

Acquérir les connaissances générales sur les méthodes de séquençage à haut-débit...

Du 15-11-2017 au 17-11-2017 à Lyon.

Analyse de données NGS sous Galaxy

Du 14-11-2017 au 16-11-2017 à Villeurbanne.

How to use South Green HPC (IRD cluster)?

Du 12-11-2017 au 12-11-2017 à Centre IRD Montpellier.

Ecole AVIESAN ITMO EBA

Du 12-11-2017 au 16-11-2017 à Roscoff.

6ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

Du 12-11-2017 au 17-11-2017 à Roscoff.

Aterlier de Bioinformatique (participation à)

Du 11-11-2017 au 16-11-2017 à Roscoff.

6ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Du 11-11-2017 au 11-11-2017 à Roscoff.

Initiation à l’Analyse des données RNAseq sous l’environnement Galaxy

Du 07-11-2017 au 09-11-2017 à Nantes.

Utilisation des outils d'interprétation des données de protéomique MSDA et Proline

Du 06-11-2017 au 06-11-2017 à IPHC - Strasbourg.

Linux et script pour la bioinformatique

Du 06-11-2017 au 07-11-2017 à Montpellier.

Assemblage de génome

Du 05-11-2017 au 05-11-2017 à Université Montpellier 1.

Metagenomic amplicon analysis with stats

Du 05-11-2017 au 08-11-2017 à Salle de formation Inra.

Initiation au cloud computing

Du 01-11-2017 au 01-11-2017 à Rennes.

Annotation of transposable elements (in the frame of Genome assembly and annotation course

Du 25-10-2017 au 25-10-2017 à Lisbonne (Portugal).

Linking gene and function, comparative genomics tools for biologists

Du 23-10-2017 au 25-10-2017 à Institut Pasteur.

Analyse avancée de séquences

Du 22-10-2017 au 24-10-2017 à CBiB.

Infrastructure de calcul et analyses en bio-informatique

Du 22-10-2017 au 26-10-2017 à Agrocampus Rennes.

Introduction au logiciel R

Acquérir les compétences nécessaires à l’utilisation du logiciel R, connaître les principales analyses statistiques ...

Du 18-10-2017 au 20-10-2017 à Lyon.

Standardizing phenotyping experimental data

Du 17-10-2017 au 17-10-2017 à Webinar.

Introduction à R

Du 17-10-2017 au 19-10-2017 à Villeurbanne.

Training for Orphanet Senior Information Scientists

Du 10-10-2017 au 12-10-2017 à Paris, France.

Training for Orphanet Junior Information Scientists

Du 10-10-2017 au 12-10-2017 à Paris, France.

Training: Synteny data visualization into GnpIS

Du 09-10-2017 au 09-10-2017 à Webinar.

Phylogénie moléculaire

La plateforme ATGC organise une formation en phylogenie moleculaire a Montpellier sur 5 jours

Du 09-10-2017 au 13-10-2017 à Montpellier.

Phylogénie moléculaire

Du 08-10-2017 au 12-10-2017 à Montpellier.

How to use a bioinformatic HPC?

Du 05-10-2017 au 05-10-2017 à ISRA, Dakar (Sénégal).

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 4/5 : Analyses de variants

Formation "Analyses de variants"

Du 02-10-2017 au 04-10-2017 à Université de Lille.

Administration système d'un cluster de calcul bilinformatique

Du 01-10-2017 au 03-10-2017 à ISRA, Dakar (Sénégal).

Survival Guide for Perl applied to Bioinformatics

This course provides an introduction to programming using Perl.

Du 01-10-2017 au 05-10-2017 à ISRA, Bel Air, Dakar (Sénégal).

Guide de survie à Perl pour la bioinformatique

Du 01-10-2017 au 05-10-2017 à ISRA, Dakar (Sénégal).

Data collection and registration of Diagnostic tests for Orphanet information scientists

Du 28-09-2017 au 28-09-2017 à Paris (à distance).

Formation "Annotation & Analyse de Génomes Procaryotes - Mise en oeuvre de la Plateforme MicroScope"

Formations dédiées à l'analyse de génomes bactériens via l'utilisation de la plate-forme MicroScope.

Du 25-09-2017 au 29-09-2017 à Evry, France.

Data collection and registration of Clinical Trials for Orphanet information scientists

Du 24-09-2017 au 24-09-2017 à Paris (à distance).

Annotation and Analysis of Procaryotic genomes using the MicroScope platform

Du 24-09-2017 au 28-09-2017 à Université d'Evry Val d'Essonne.

Data collection and registration of Research Projects for Orphanet information scientists

Du 21-09-2017 au 21-09-2017 à Paris (à distance).

Formation CeSGO

Du 20-09-2017 au 20-09-2017 à Rennes.

Data collection and registration of Patient organisations for Orphanet information scientists

Du 18-09-2017 au 18-09-2017 à Paris (à distance.

Data collection and registration of Expert Centres for Orphanet information scientists

Du 14-09-2017 au 14-09-2017 à Paris (à distance).

Introduction à Unix/Linux pour les biologistes

Du 02-09-2017 au 14-10-2017 à Lyon.

Genopole Summer School

Bioinformatic and Biostatistic tools in medical genomics

Du 04-07-2017 au 07-07-2017 à Châteauform' Seine Port (77).

Sequence analysis of amplicons from MiSeq and 454 sequencing with FROGS with Galaxy first step and statistics

Training designed to help you to deal with NGS data of 16S, 18S, DNA produced with MiSeq from Illumina and Roche 454 techno...

Du 03-07-2017 au 03-07-2017 à Auzeville-Tolosane.

Metagenomic amplicon analysis with stats

Du 02-07-2017 au 05-07-2017 à Salle de formation Inra.

Formation CeSGO

Du 02-07-2017 au 02-07-2017 à Rennes.

Module 2 : RNAseq bioinformatic from sequence to expression level smallRNA & isoform (eukaryote)

Du 29-06-2017 au 29-06-2017 à Gif sur Yvette.

Workshop Web Viewers

Du 27-06-2017 au 27-06-2017 à Laboratoire MTi, Paris.

Analyse avancée de séquences sur mesure

Du 25-06-2017 au 26-06-2017 à BIOMNIS, Lyon.

Annotation of transposable elements (in the frame of Genome assembly and annotation course

Du 21-06-2017 au 21-06-2017 à Ljubjana (Slovenie).

Analyse de données métagénomiques 16S

Du 19-06-2017 au 22-06-2017 à Jouy en Josas.

Rendre ses outils disponibles sur un cloud OpenStack

Du 19-06-2017 au 19-06-2017 à IBMP (UPR2357).

« STATIMAGE», Statistiques pour l’imagerie de microscopie

Du 18-06-2017 au 20-06-2017 à CIEP, Sèvres.

Formation librairie GATB

Du 15-06-2017 au 15-06-2017 à Montpellier.

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 3/5 : Analyses ChIP-seq

Formation "Analyses ChIP-seq"

Du 12-06-2017 au 13-06-2017 à Université de Lille.

Python for Biology

Formantion payante du catalogue CNRS

Du 06-06-2017 au 08-06-2017 à CBiB, Bordeaux.

Data Analysis boot camp

This course will give participants basic skills and hands-on training in biostatistics and descriptive data analysis.

Du 06-06-2017 au 15-06-2017 à Institut Pasteur.

Training on annotation of transposable elements

Du 05-06-2017 au 08-06-2017 à INRA-URGI-Versailles.

Rrr - Rapide IntRoduction à R (R pour la génomique)

Du 30-05-2017 au 01-06-2017 à ICM.

Training on GnpIS for BreedWheat data

Du 29-05-2017 au 29-05-2017 à Webinar.

Workflow4Experimenters International Course

Du 29-05-2017 au 02-06-2017 à Pasteur Institute, PARIS.

How to use South Green HPC (IRD cluster)?

Du 28-05-2017 au 28-05-2017 à IRD, Montpellier.

Workflow4Experimenters

Du 28-05-2017 au 01-06-2017 à Paris Pasteur.

RNASeq with Galaxy

Du 22-05-2017 au 23-05-2017 à Roscoff.

Cluster - Usage

Du 17-05-2017 au 17-05-2017 à Roscoff.

Linux advanced

Du 16-05-2017 au 16-05-2017 à Roscoff.

G4I

Galaxy4Imaging : Formation à l'intégration d'outils sous Galaxy dans le domaine de l'imagerie

Du 16-05-2017 au 17-05-2017 à Nantes.

Linux - Initiation

Du 15-05-2017 au 15-05-2017 à Roscoff.

RNAseq alignment and transcript assemblies with statistics

Du 15-05-2017 au 18-05-2017 à Salle de formation Inra.

Développement d'outils galaxy pour l'imagerie

Du 15-05-2017 au 16-05-2017 à Nantes.

Atelier Inserm 246 | Gestion et réutilisation des données en santé : enjeux méthodologiques

Aperçu des outils et bonnes pratiques pour une meilleure gestion, un partage responsable et une réutilisation des données en sant

Du 15-05-2017 au 17-05-2017 à Bordeaux.

Formation MIGALE - Annotation de génomes microbiens

Module en préparation ...

Du 15-05-2017 au 15-05-2017 à Jouy en Josas.

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 4/4 : Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Formation "Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire"

Du 11-05-2017 au 12-05-2017 à Université de Lille.

Cours MIGALE - Perl avancé

Aller plus loin avec Perl afin d’être autonome pour des manipulations complexes visant à extraire et reformater des données iss...

Du 11-05-2017 au 11-05-2017 à Jouy en Josas.

Perl avancé

Du 10-05-2017 au 10-05-2017 à Jouy en Josas.

Formation MIGALE - Initiation à Perl

Initiation à la programmation. Identifier les possibilités offertes par l’écriture de quelques lignes de code...

Du 09-05-2017 au 09-05-2017 à Jouy en Josas.

Initiation à Perl

Du 08-05-2017 au 09-05-2017 à Jouy en Josas.

Formation MIGALE - Traitements bioinfo RNA-seq

Traitement bioinformatique des données RNA-Seq

Du 03-05-2017 au 03-05-2017 à Jouy en Josas.

Traitement bioinformatique des données RNA-Seq

Du 02-05-2017 au 03-05-2017 à Jouy en Josas.

Linux et script pour la bioinformatique

Du 02-05-2017 au 03-05-2017 à Montpellier.

Annotation formelle pour la fouille de texte

Du 01-05-2017 au 01-05-2017 à Jouy en Josas.

Initiation à GO-Docker

Du 17-04-2017 au 17-04-2017 à Rennes.

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 2/5 : Analyses RNA-seq

Formation " Analyses RNA-seq"

Du 05-04-2017 au 07-04-2017 à Université de Lille.

R - Advanced

Du 04-04-2017 au 04-04-2017 à Roscoff.

R - Initiation

Du 03-04-2017 au 03-04-2017 à ROSCOFF.

École thématique – Bioinformatics of protein-protein interactions for wet lab scientists

Bioinformatics of protein-protein interactions for wet lab scientists

Du 03-04-2017 au 07-04-2017 à Institut Pasteur.

Bioinformatics of protein--protein interactions for wet lab scientists

Du 02-04-2017 au 06-04-2017 à Institut Pasteur.

Bioinformatique pour le traitement de données de séquençage (NGS)

Bioinformatics for NGS data analysis

Du 27-03-2017 au 31-03-2017 à Montpellier.

Cours MIGALE - Analyse de données métagénomiques 16S

Formation dédiée à l'analyse de données de type "métagénomique amplicon" issues des technolo-gies de séquençage 454 et Illumina.

Du 27-03-2017 au 27-03-2017 à Jouy en Josas.

Bioinformatique pour le traitement de données de séquençage (NGS)

Du 26-03-2017 au 30-03-2017 à Montpellier.

COURS PROGRAMMATION SCIENTIFIQUE EN PYTHON

Du 26-03-2017 au 30-03-2017 à Institut Pasteur.

Analyse de données métagénomiques 16S

Du 26-03-2017 au 29-03-2017 à Jouy en Josas.

Formation MIGALE - Modélisation 3D des protéines

Analyse in silico de structures 3D de protéines. Modélisation par homologie de protéines homologues, sauvage et mutées...

Du 23-03-2017 au 23-03-2017 à Jouy en Josas.

: Analyse in silico de structures 3D de protéines. Modélisation par homologie de protéines homologues, sauvage et mutées, arrimage de ligands.

Du 22-03-2017 au 23-03-2017 à Jouy en Josas.

Scientific Programming in Python

This course is intended for PhD students, engineers and research scientists willing to acquire knowledge in scientific programming

Du 19-03-2017 au 30-03-2017 à Institut Pasteur.

Ecole Thématique Internationale en Biologie des Systèmes Computationnelle

Sensibiliser les chercheurs à la richesse et à l’élégance des problématiques de biologie systémique

Du 19-03-2017 au 25-03-2017 à Aussois.

Formation MIGALE - Analyse statistique RNA-seq sous Galaxy

Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio et Galaxy)

Du 16-03-2017 au 16-03-2017 à Jouy en Josas.

Analyse statistique de données RNA-Seq - Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio et Galaxy)

Du 15-03-2017 au 16-03-2017 à Jouy en Josas.

Analyse bioinformatique de données RNA-Seq sous Galaxy

Du 14-03-2017 au 14-03-2017 à Jouy en Josas.

Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy

Connaître les concepts et méthodes bioinformatiques utilisés pour l’analyse primaire de données issues de NGS...

Du 14-03-2017 au 14-03-2017 à unité MaIAGE, Jouy-en-Josas.

NGS sous Galaxy

Du 13-03-2017 au 13-03-2017 à Jouy en Josas.

Initiation à Galaxy

Du 12-03-2017 au 12-03-2017 à Jouy en Josas.

Annotation and Analysis of Procaryotic genomes using the MicroScope platform

Du 12-03-2017 au 16-03-2017 à Faculté d'Evry Val d'Essonne.

Formation MIGALE - Python avancé

Etre autonome pour des manipulations simples visant à extraire, reformater des données issues de fichiers texte.

Du 10-03-2017 au 10-03-2017 à Jouy en Josas.

Read alignment and SNP calling

Découvrir les formats de sortie des séquenceurs nouvelle génération, les nouveaux formats d’assemblage et les biais connus ...

Du 08-03-2017 au 08-03-2017 à Auzeville-Tolosane.

Formation MIGALE - Initiation à Python

Initiation à la programmation. Réalisation de tâches simples d'extractions d'informations.

Du 08-03-2017 au 08-03-2017 à Jouy en Josas.

Read alignment and small size variants calling

Du 07-03-2017 au 08-03-2017 à Salle de formation Inra.

Initiation à Python

Du 07-03-2017 au 08-03-2017 à Jouy en Josas.

Formation au cluster Genotoul

Cette formation explique comment on se sert du cluster et des banques de données installées sur la plate-forme.

Du 07-03-2017 au 07-03-2017 à Auzeville-Tolosane.

Formation MIGALE - Initiation à R

Initiation à R

Du 07-03-2017 au 07-03-2017 à Jouy en Josas.

Cluster

Du 06-03-2017 au 06-03-2017 à Salle de formation Inra.

Formation Genotoul Linux/Unix

Accéder à la plate‐forme, utiliser un environnement Unix, créer, manipuler et transférer des fichiers en ligne de commande ...

Du 06-03-2017 au 06-03-2017 à Auzeville-Tolosane.

Unix

Du 05-03-2017 au 05-03-2017 à Salle de formation Inra.

Rrr - Rapide IntRoduction à R (R pour la génomique)

Du 05-03-2017 au 16-03-2017 à ICM.

Initiation à R

Du 04-03-2017 au 05-03-2017 à Jouy en Josas.

Python avance

Du 28-02-2017 au 28-02-2017 à Jouy en Josas.

Phylogénie

Du 23-02-2017 au 23-02-2017 à LISBP.

Metagenomic amplicon analysis/Frogs

Du 19-02-2017 au 22-02-2017 à Salle de formation Inra.

TOGGLe, a workflow manager to performe large-scale NGS analysis

Du 19-02-2017 au 19-02-2017 à Centre IRD Montpellier.

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 3/4 : Prédiction de gènes et annotation de protéines

Formation "Prédiction de gènes et annotation de protéines"

Du 16-02-2017 au 17-02-2017 à Université de Lille.

How to use South Green HPC (IRD cluster)?

Du 07-02-2017 au 07-02-2017 à Centre IRD Montpellier.

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 1/5 : Analyses ADN

Formation "Analyses ADN"

Du 06-02-2017 au 07-02-2017 à Université de Lille.

European Galaxy Developer Workshop

European edition of the Galaxy for Bioinformatics Workshop

Du 16-01-2017 au 19-01-2017 à Strasbourg, France.

European Galaxy Developer Workshop

Du 15-01-2017 au 18-01-2017 à Strasbourg.

Workflow4Metabolomics 2016

Using Galaxy and the Workflow4metabolomics infrastructureto analyse metabolomics data

Du 28-11-2016 au 02-12-2016 à Roscoff, France.

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 2/4 : Alignement de séquences

Formation "Alignement de séquences"

Du 24-11-2016 au 25-11-2016 à Université de Lille.

Journées SUCCES 2016

Présenter des travaux scientifiques, dans toutes les disciplines, réalisés grâce à des infrastructures de grilles de calc...

Du 23-11-2016 au 24-11-2016 à Institut de Physique du Globe, Paris.

Détection et Annotation des éléments transposables dans les génomes eucaryotes

Formation sur la détection et l'annotation des éléments transposables

Du 20-11-2016 au 22-11-2016 à INRA-URGI, Centre de Versailles.

5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

Du 20-11-2016 au 25-11-2016 à Roscoff.

Analyse de données RNA-seq sous Galaxy

Séquençage haut débit, analyse du transcriptome, navigateur de génome...

Du 15-11-2016 au 16-11-2016 à PRABI-Doua, Villeurbanne.

Introduction à la Phylogénie Moléculaire : CONCEPTS, METHODES ET OUTILS

Le C3BI propose des cours pour acquérir les notions théoriques de phylogénie et maitriser les outils et logiciels.

Du 13-11-2016 au 24-11-2016 à Institut Pasteur 25-28 rue du Dr Roux 75015 Paris.

Making efficient NGS data analysis softwares

GATB devel day: learn the basics of the high-performance NGS data processing GATB-Core library

Du 09-11-2016 au 09-11-2016 à Institut Henri Poincaré, Paris, France.

Initiation à Galaxy

Formation "Initiation à Galaxy"

Du 07-11-2016 au 07-11-2016 à Université de Lille.

Formations Cloud IFB IBI-2

Utilisation avancée du cloud IFB

Du 19-10-2016 au 19-10-2016 à IFB, Gif-sur-Yvette.

Galaxy4Bioinformatics

Formation aux bonnes pratiques d'intégration d'outils sous Galaxy

Du 18-10-2016 au 20-10-2016 à Lyon.

Formations Cloud IFB IBI-1

Formation sur l'utilisation de base du cloud IFB

Du 18-10-2016 au 18-10-2016 à IFB, Gif-sur-Yvette.

Formation à R

Principales analyses statistiques sous R, graphiques, librairies de biologie...

Du 12-10-2016 au 14-10-2016 à PRABI-Doua, Villeurbanne.

Metagenomics: amplicon analysis under Galaxy

Use our Galaxy instance, clean reads, clusterize them, do the taxonomic affiliation and perform statistics to interpret results

Du 10-10-2016 au 13-10-2016 à INRA Auzeville, France.

Phylogénie moléculaire

La plateforme ATGC organise une formation en phylogenie moleculaire a Montpellier sur 5 jours

Du 09-10-2016 au 13-10-2016 à Montpellier.

Summer School 2016 in Metagenomics

Du 12-09-2016 au 16-09-2016 à Paris.

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 1/4 : Banques de données et Blast

Formation "Banques de données et BLAST"

Du 07-09-2016 au 08-09-2016 à Université de Lille.

Formations Cloud IFB IBI-3

Développement de machines virtuelles modèles (appliances)

Du 13-07-2016 au 13-07-2016 à IFB-Core, Gif sur Yvette.

Intégration d'outils dans Galaxy

Workshop organisé sur les bonnes pratiques d'intégration, dans Galaxy, des outils disponibles dans le toolshed.

Du 24-05-2016 au 24-05-2016 à Clermont-Ferrand - Université d'Auvergne.

Galaxy : alignment and variant calling

Formats de fichiers, alignements des reads sur un génome de référence et de detection de SNP et petits indels via GATK

Du 18-05-2016 au 19-05-2016 à INRA de Toulouse/Auzeville.

Galaxy First Step

Initiation à l'environnement Galaxy, prise en main de l'instance toulousaine et apprentissage des bonnes pratiques d'utilisation.

Du 17-05-2016 au 17-05-2016 à INRA de Toulouse/Auzeville.

Génomique / Bioinformatique « 2 en 1 »

RNA-Seq

Du 22-04-2016 au 22-04-2016 à Bordeaux.

Formations Cloud IFB

Cursus de formation sur le cloud IFB IBI-1

Du 19-04-2016 au 19-04-2016 à Gif sur Yvette.

Formation France Génomique

Formation Cloud et Galaxy IFB pour France Génomique

Du 29-02-2016 au 03-03-2016 à Gif sur Yvette.

Formations passés