

Type de formation:
Formation professionnelle
Description:
Objectifs
Connaître les concepts et méthodes bioinformatiques utilisés pour l’analyse primaire de données issues de NGS. Application aux outils de mapping et d’assemblage.
Programme
Théorie
•Présentation des différents types de séquenceurs
•Les grandes familles d’algorithmes de mapping de lectures courtes d’assemblage et les outils associés
Pratique
Analyse des données de séquençage d’un génome bactérien
•Contrôle qualité
•Assemblage de-novo
oNettoyage des données
oAssemblage
oVisualisation et statistiques sur l’assemblage
•Comparaison à un génome de référence :
oMapping des lectures sur un génome proche
oVisualisation du mapping
Nombre de personnes formées:
10/ an
Temps de formation:
1 jours / an
Conditions d'accès à la formation:
Ce cycle est ouvert à l'ensemble des agents de l'INRA et aux extérieurs.
Nombre de sessions:
1
Reccurance:
Oui
Lien vers la formation:
Date de la session:
Mardi, mars 14, 2017 (All day)
Lieu de la formation:
Jouy en Josas
Cours résumé:
Connaître les concepts et méthodes bioinformatiques utilisés pour l’analyse primaire de données issues de NGS.
Thème (formations professionnelles uniquement):
Mots clés: