Type de formation: 
Formation professionnelle
Description: 
Objectifs

Connaître les bases de la modélisation moléculaire : modélisation par homologie, arrimage (docking) de ligands, mutations in silico. Une demi-journée dédiée à la modélisation de vos protéines d'intérêts.

Programme

- Visualiser : Connaître les bases de la visualisation des protéines en 3D avec PYmol.

- Comprendre : Analyse des structures 3D de protéines (RX ou RMN). Recherche d'homologues avec HHpred, I-Tasser, etc... Modélisation par homologie avec Modeller, Phyre2. Principes et applications.

- Prédire : Docking de ligands avec Autodock. Prédiction des mutations in silico. Principes et applications.

  • L'accent sera mis sur les points forts et les limites des différents outils et la pratique avec de nombreux "hand- on tutorials"
  • Plus une session dédiée : «bring your own protein».
Nombre de personnes formées: 
7/ an
Temps de formation: 
2 jours / an
Conditions d'accès à la formation: 

Ce cycle est ouvert à l'ensemble des agents de l'INRA et aux extérieurs.

Nombre de sessions: 
1
Reccurance: 
Oui
Date de la session: 
Jeudi, mars 23, 2017 (All day)
Lieu de la formation: 
Jouy en josas
Cours résumé: 
Analyse in silico de structures 3D de protéines. Modélisation par homologie de protéines homologues, sauvage et mutées...
Thème (formations professionnelles uniquement): 
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