

Cette formation initie l’utilisation de Stacks dans l’environnement Galaxy.
En se basant sur une plateforme web, comme c’est la cas avec Mobyle, nous proposons une nouvelle utilisation de Stacks pour rendre l’analyse biologique plus aisée pour les non- informaticiens.
Objectifs
Principe de l’analyse de données RAD-seq via Stacks.
Organisation pédagogique
La formation comprendra un exposé théorique avec démonstrations pratiques.
Le programme :
1/ Présentation théorique du fonctionnement global de Stacks. Compter 1h
2/ Analyse de données RAD avec Stacks sous Galaxy. 3h
a) cartographie génétique
b) génomique des populations
c) assemblage de données pairées
Public visé
Chercheurs et ingénieurs, biologistes et bio-informaticiens souhaitant analyser des données de type RAD-seq dans le portail web Galaxy.