

bilille propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.
Ce cycle est composé de 5 modules, à la carte :
- Module 1: Analyses ADN
- Module 2: Analyses de variants
- Module 3: Analyses RNA-seq, bioinformatique
- Module 4: Analyses RNA-seq, biostatistique
- Module 5: Métagénomique
Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.
Les objectifs du module 2 sont :
- Comprendre les grands principes de la détection de variants
- Réaliser les différentes étapes du post-traitement des données d’alignement à la détection de variants
- Adapter l’analyse en fonction du type de données NGS générées
- Comprendre la structure des données de variants
- Savoir annoter des variants
- Etre capable d’interpréter une liste de variants grâce aux outils libres disponibles
Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Sylvain Legrand (mails)
- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement