Type de formation:
Formation professionnelle
Description:
bilille propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.
Ce cycle est composé de 5 modules, à la carte :
- Module 1: Analyses ADN
- Module 2: Analyses de variants
- Module 3: Analyses RNA-seq, bioinformatique
- Module 4: Analyses RNA-seq, biostatistique
- Module 5: Métagénomique
Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.
Les objectifs du module 4 sont :
- Savoir réaliser une analyse différentielle de données RNA-seq à partir d’une table de comptage (quantifiant les lectures alignées) à l’aide du portail Galaxy
- Avoir un regard critique sur les résultats d’une analyse différentielle
- Comprendre différentes méthodes de normalisation et les contextes d’utilisation correspondants
Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Sylvain Legrand (mails)
Nombre de personnes formées:
12/ an
Temps de formation:
2 jours / an
Conditions d'accès à la formation:
- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 2/5 «Analyses RNA-seq–partie 1 (bioinformatique)» de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et la façon d’obtenir une table de comptage
Nombre de sessions:
1
Lien vers la formation:
Date de la session:
Lundi, septembre 16, 2019 (All day) to Mardi, septembre 17, 2019 (All day)
Lieu de la formation:
Université de Lille
Cours résumé:
Formation "Analyses RNA-seq -partie 2"
Thème (formations professionnelles uniquement):
Nombre de jours:
2.00
Taux de satisfaction des apprenants:
100%
