Type de formation: 
Formation professionnelle
Description: 

bilille propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

Ce cycle est composé de 5 modules, à la carte : 

- Module 1: Analyses ADN

- Module 2: Analyses de variants

- Module 3: Analyses RNA-seq, bioinformatique

- Module 4: Analyses RNA-seq, biostatistique

- Module 5: Métagénomique

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 4 sont :

- Savoir réaliser une analyse différentielle de données RNA-seq à partir d’une table de comptage (quantifiant les lectures alignées) à l’aide du portail Galaxy

- Avoir un regard critique sur les résultats d’une analyse différentielle

- Comprendre différentes méthodes de normalisation et les contextes d’utilisation correspondants

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Sylvain Legrand (mails)

Nombre de personnes formées: 
12/ an
Temps de formation: 
2 jours / an
Conditions d'accès à la formation: 

- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 2/5 «Analyses RNA-seq–partie 1 (bioinformatique)» de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et la façon d’obtenir une table de comptage

Nombre de sessions: 
1
Date de la session: 
Lundi, septembre 16, 2019 (All day) to Mardi, septembre 17, 2019 (All day)
Lieu de la formation: 
Université de Lille
Cours résumé: 
Formation "Analyses RNA-seq -partie 2"
Thème (formations professionnelles uniquement): 
Nombre de jours: 
2.00
Taux de satisfaction des apprenants: 
100%
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