Formation MicroScope 2020 session 2

Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform

From 23-11-2020 to 27-11-2020 at Université Evry Paris-Saclay.

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Phylogénie moléculaire

Acquérir des connaissances théoriques et pratiques en phylogénie moléculaire

From 02-11-2020 to 05-11-2020 at Villeurbanne (69).

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Analyse avancée de séquences

From 12-10-2020 to 14-10-2020 at Bordeaux (33).

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Phylogénie moléculaire - formation avancée

3 jours pour être capable de tester des hypothèses et d'ajuster des modèles et comprendre l'évolution à l'échelle moléculaire

From 05-10-2020 to 07-10-2020 at Montpellier (34).

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9ème école de bioinformatique AVIESAN - IFB - INSERM

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

From 04-10-2020 to 09-10-2020 at la Station biologique de Roscoff.

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Workshop CNRS Single-Cell 2020

Ecole thématique CNRS Single-Cell // Transcriptomique et épigénomique en cellule unique: théorie et pratique (sincellTE)

From 27-09-2020 to 02-10-2020 at Station Biologique Roscoff.

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Bioinformatique pour le traitement de données de séquençage (NGS)

From 20-09-2020 to 20-09-2020 at Montpellier (34).

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Les principes FAIR appliqués à la bioinformatique

Introduction à la reproductibilité et à la science ouverte

From 31-08-2020 to 02-09-2020 at Paris.

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Formation MicroScope 2020 session 1

Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform

From 16-03-2020 to 20-03-2020 at Université Evry Paris-Saclay.

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DIPLÔME UNIVERSITAIRE EN BIOINFORMATIQUE INTÉGRATIVE : DU-BII 2020

From 02-03-2020 to 19-06-2020 at Université Paris Diderot, France.

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Train the Trainers 2020

ELIXIR Train-the-Trainers (TtT)

From 10-02-2020 to 11-02-2020 at l'Ecole Normale Superieur, Biology Departement (IBENS).

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W4E 2020

During this one-week course, Participants will learn how to use the W4M infrastructure to analyze their own dataset

From 03-02-2020 to 07-02-2020 at Centre For Fine Arts (BOZAR), rue Royale n°10 to 1000 - Brussels (Belgium).

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Administration avancée de HPC à destination d'administrateurs systèmes d'Afrique de l'Ouest

utilisation avancée de l'administration de HPC à destination d'administrateurs systèmes d'Afrique de l'Ouest

From 11-01-2020 to 11-01-2020 at Université de Ouagadougou, Burkina faso.

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Metabarcode

From 02-12-2019 to 06-12-2019 at Roscoff .

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ELIXIR Biohackathon 2019

BioHackathon activities are driven by practical sessions where people gather, discuss, and implement ideas/projects

From 18-11-2019 to 22-11-2019 at Paris area (berges de Seine).

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Formation MicroScope 2019

Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform

From 18-11-2019 to 22-11-2019 at Université Evry Paris-Saclay.

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Intiation aux analyses de données NGS - 2

Une formation offrant des connaissances pluridisciplinaires dans le domaine de la bioinformatique...

From 04-11-2019 to 04-11-2019 at Montpellier, France.

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8ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

From 03-11-2019 to 08-11-2019 at la Station biologique de Roscoff.

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Analyse avancée de séquences

Cette formation a pour objectif de : savoir rechercher des informations dans les banques de données, maîtriser les outils...

From 29-10-2019 to 31-10-2019 at Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB).

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Analyses NGS avec R

savoir analyser des séquences de reads NGS, déterminer les ARN messagers différentiellement exprimés et enrichir les résultats

From 24-10-2019 to 25-10-2019 at Centre de bioinformatique de Bordeaux (CBiB).

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R introduction

Cette formation a pour objectif d' acquérir les bases pour l'utilisation du langage R.

From 22-10-2019 to 23-10-2019 at Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB).

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Intiation aux analyses de données NGS - 1

Une formation offrant des connaissances pluridisciplinaires dans le domaine de la bioinformatique...

From 21-10-2019 to 21-10-2019 at Montpellier.

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Modify and extract information from large text files

From 15-10-2019 to 15-10-2019 at INRA Auzeville-Tolosane, France.

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Métabolomique

Principes de la métabolomique et les ressources biostatistiques et bioinformatiques disponibles pour l'analyse de ces données.

From 15-10-2019 to 15-10-2019 at Polytech'Lille, amphi Migeon (rez-de-chaussée), Lille.

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Phylogénie moléculaire

Introduction théorique et pratique de la phylogénie moléculaire

From 07-10-2019 to 11-10-2019 at Montpellier.

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RNASeq Analysis with Galaxy

From 01-10-2019 to 01-10-2019 at Roscoff .

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Analyse statistique de données RNA-Seq - Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio)

Se sensibiliser aux concepts et méthodes statistiques pour l'analyse de données transcriptomiques de type RNA-Seq.

From 26-09-2019 to 27-09-2019 at Jouy en Josas.

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Assemblage de transcriptome

Assemblage de novo des transcrits avec Trinity...

From 25-09-2019 to 27-09-2019 at Montpellier.

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Analyse de données métagénomiques 16S

Cette formation est dédiée à l'analyse de données de type "metabarcoding" issues de la technologie de séquençage Illumina.

From 16-09-2019 to 18-09-2019 at Jouy en Josas.

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Initiation au langage R

Apprendre les principales fonctionnalités du langage R et ses principes

From 12-09-2019 to 13-09-2019 at Jouy en Josas, France.

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Functional analysis and interpretation of proteomic data with ProteoRE

ProteoRE permet d’interpréter des données de protéomique de façon interactive, reproductible et collaborative.

From 10-07-2019 to 11-07-2019 at Campus de Beaulieu, IFSIC, Rennes, FR. Bâtiment/Building 12D, room 102.

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Formation au package R-Shiny

From 09-07-2019 to 10-07-2019 at I. Pasteur, Paris.

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Genopole Summer School 2019

Bioinformatic and Biostatistic tools in medical genomics

From 24-06-2019 to 28-06-2019 at Châteauform' Seine Port (77).

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Introduction au Langage de Programmation R

La Plateforme BiRD, avec le support du service Focal de la Faculté des Sciences et Techniques, organise une nouvelle formation.

From 06-06-2019 to 06-06-2019 at Faculté de Pharmacie de Nantes.

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Initiation à la programmation pour l’analyse de données génomiques

From 27-05-2019 to 27-05-2019 at Lyon.

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Single cell RNA-seq data analysis with R

This hands-on course covers several aspects of single cell RNA-seq data analysis, ranging from clustering and so on

From 27-05-2019 to 29-05-2019 at CSC at Keilaranta 14, Espoo, Finland.

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Introduction to R Language

From 20-05-2019 to 20-05-2019 at CBiB.

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RNaseq with Galaxy

From 19-05-2019 to 20-05-2019 at Roscoff.

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Marseille Hackathon Training Event

3-days training session / hackathon in Marseille

From 23-04-2019 to 26-04-2019 at Faculté des science de Luminy, Marseille.

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Elixir Galaxy Community - Workshop at Roscoff/France

Galaxy training and hackathon sessions

From 23-04-2019 to 26-04-2019 at Station Biologique de Roscoff, France.

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ELIXIR Software Carpentry Workshop 2019

Teaching basic lab skill for Research Computing

From 15-04-2019 to 16-04-2019 at INSTITUT JACQUES MONOD - Université Paris Diderot/CNRS .

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Analyse fonctionnelle et interprétation de données de protéomique avec ProteoRE

Mis en oeuvre des outils de la plate-forme web ProteoRE pour l'annotation des protéomes

From 14-03-2019 to 15-03-2019 at Institut des Systèmes Complexes (ISC-PIF), 113 rue Nationale 75013 Paris.

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Formations dans le cadre du Mésocentre

From 12-03-2019 to 12-03-2019 at Campus des Cézeaux, Aubière.

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WAVES Training 2019

We organize a workshop to train users to WAVES, a Web Application for Versatile Enhanced Bioinformatic Services

From 11-03-2019 to 11-03-2019 at Lille.

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Gestion de données en Python - Avancé

From 02-03-2019 to 03-03-2019 at Roscoff.

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Gestion de données avec Python : Initiation

From 28-02-2019 to 01-03-2019 at Roscoff.

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Manual curation of Transposable element annotation

URGI organizes a BYOD-style (Bring Your Own Data) training course on manual curation of transposable elements reference sequences

From 03-02-2019 to 05-02-2019 at URGI INRA, Bat 18 Route de SaintCyr RD10, 78026 Versailles Cedex.

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Course single-cell transcriptomics and epigenomics 2019

Single-cell transcriptomics and epigenomics: theory and practice (sincellTE)

From 03-02-2019 to 08-02-2019 at Station Biologique Roscoff.

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Diplôme Universitaire en bioinformatique intégrative 2019

L'université Paris Diderot en partenariat avec l'IFB propose un diplôme un universitaire en bioinformatique

From 01-02-2019 to 01-02-2019 at Université Paris-Diderot.

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INTRODUCTION À L'ANALYSE DE DONNÉES

From 13-01-2019 to 07-02-2019 at Institut Pasteur.

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WAVES Training

We organize a workshop to train users to WAVES, a Web Application for Versatile Enhanced Bioinformatic Services

From 18-12-2018 to 18-12-2018 at Institut Pasteur (Paris).

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7ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

From 25-11-2018 to 30-11-2018 at Station biologique de Roscoff.

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RNASeq alignment and transcripts assemblies

RNAseq analysis

From 14-11-2018 to 15-11-2018 at Auzeville-Tolosane.

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Analyse des données RNA-Seq sous l'environnement Galaxy

From 13-11-2018 to 15-11-2018 at Lyon.

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Linux/Unix

This training session has been designed to familiarize yourself with the platform resources and its organization.

From 12-11-2018 to 12-11-2018 at Auzeville-Tolosane.

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Formation au logiciel R

Formation à l'utilisation de R appliqué à la bioinformatique

From 08-10-2018 to 10-10-2018 at Lyon.

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W4E 2018

During this one-week course, participants will learn how to use the W4M infrastructure to analyze their own dataset.

From 08-10-2018 to 12-10-2018 at Pasteur Institute - Paris.

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Data analysis

From 07-10-2018 to 11-10-2018 at Ecole Normale Supérieure.

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Analyse de données NGS dédiée à la génomique végétale en Afrique de l'Ouest

Cette formation présente les technologies de séquençages et les différentes analyses possibles pour exploiter ces données.

From 03-10-2018 to 11-10-2018 at CERAAS, Thiès (Sénégal).

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Installing and Managing a High-Performance Computing (HPC) Cluster

This course ran for 5 days covering all the concepts necessary to install and manage a high-performance computing (HPC) cluster.

From 30-09-2018 to 04-10-2018 at CERAAS, Thiès (Sénégal).

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Elixir Training: Plant Genome Assembly and Annotation

The course is aimed at researchers interested in learning more about genome assembly and annotation

From 24-09-2018 to 28-09-2018 at Cirad Montpellier.

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ChIP-seq, RNA-seq et Hi-C : traitement, analyse et visualisation de données

Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq, RNA-seq et Hi=C

From 26-06-2018 to 29-06-2018 at Montpellier.

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Genopole Summer School 2018

Bioinformatic and Biostatistic tools in medical genomics

From 25-06-2018 to 29-06-2018 at Châteauform' Seine Port (77).

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Ecole thématique CNRS 2018

Transcriptomique et épigénomique en cellule unique: théorie et pratique (sincellTE)

From 17-06-2018 to 22-06-2018 at Station Biologique Roscoff.

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Détection et annotation des éléments transposables dans les génomes eucaryotes

L'URGI organise une formation sur la détection et l'annotation des éléments transposables par les pipelines REPET.

From 11-06-2018 to 13-06-2018 at URGI - INRA de Versailles .

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RNAseq de novo assembly - Genotoul (second session)

Training course for bio-informaticians and biologists aiming at introduce analysis of sequences

From 05-06-2018 to 05-06-2018 at Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

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Anniversary RSAT/GINsim

RSAT and GINsim are reaching their 20th and 15th anniversary, respectively.

From 16-05-2018 to 17-05-2018 at Ecole Normale Supérieure Paris.

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analyse de données metabarcoding

introduire les concepts clés liés aux analyses de metabarcoding et les illustrer au moyen de cas concrets d’analyse

From 13-05-2018 to 17-05-2018 at ROSCOFF.

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Metabarcoding analyses (using FROGS in Galaxy and Phyloseq)

This course offers an introduction to metabarcoding analyses at two different levels (FROGS pipeline, PhyloSeq R package).

From 22-04-2018 to 22-04-2018 at Centre IRD, Montpellier.

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Metagenomic: amplicons and stats

Familiarization with the hardware infrastructure, biological data banks and widely used bioinformatics softwares ...

From 09-04-2018 to 12-04-2018 at Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

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ELIXIR Software Carpentry Workshop

Teaching basic lab skill for Research Computing

From 28-03-2018 to 29-03-2018 at l'Institut Pasteur (Paris).

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Train the Trainers

ELIXIR-EXCELERATE Train-the-Trainers (TtT)

From 26-03-2018 to 27-03-2018 at l'Institut Pasteur.

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Initiation to NGS Workflow Managers developed within the South Green Platform: Galaxy and TOGGLe

This course provides introduction to workfow managers to quickly develop and run their own pipelines.

From 22-03-2018 to 22-03-2018 at Centre IRD, Montpellier.

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Détection de variants à partir de données NGS

From 18-03-2018 to 18-03-2018 at Université Montpellier 1.

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Analyse de séquences

From 18-03-2018 to 22-03-2018 at Institut Pasteur.

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RNASeq analyses (using Galaxy and TOGGLe)

This course offers an introduction to RNASeq analyses using two different workflow management systems: Galaxy and TOGGLe

From 15-03-2018 to 15-03-2018 at Centre IRD, Montpellier.

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Galaxy - Initiation

From 14-03-2018 to 14-03-2018 at ROSCOFF.

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High-performance computing Course

This course provides a general introduction to High Performance Computing (HPC) using the HPC South green clusters.

From 14-03-2018 to 14-03-2018 at Centre IRD, Montpellier.

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NGS et Cancer (Canceropôle) : Analyse DNASeq

From 13-03-2018 to 13-03-2018 at .

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NGS et Cancer (Canceropôle) : Analyse A-RNASeq

From 13-03-2018 to 13-03-2018 at .

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NGS et Cancer (Canceropôle) : Analyse épigénomique

From 13-03-2018 to 13-03-2018 at .

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IFSBM (UFR medecine paris sud) : Big Data

From 13-03-2018 to 13-03-2018 at .

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Linux For Jedi

From 12-03-2018 to 12-03-2018 at Centre IRD, Montpellier.

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Linux For Dummies

From 11-03-2018 to 11-03-2018 at Centre IRD, Montpellier.

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Analyse RNA-seq sous Galaxy

From 05-03-2018 to 05-03-2018 at Rennes.

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Administration Galaxy

From 26-02-2018 to 26-02-2018 at Mésocentre Clermont Auvergne.

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Administration Galaxy

Installer, configurer, et customiser un serveur Galaxy. Avoir les bonnes pratiques d’installation et gestion d’un serveur Galaxy.

From 26-02-2018 to 26-02-2018 at Mésocentre Clermont Auvergne.

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RNAseq de novo assembly - Genotoul

Training course for bio-informaticians and biologists aiming at introduce analysis of sequences

From 06-02-2018 to 06-02-2018 at Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

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Reads alignment and small size variants calling with Galaxy

Introduction to NGS data, in particular Illumina technologies.

From 01-02-2018 to 02-02-2018 at Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

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Galaxy initiation, RNAseq, SARTools

Course for biologists aiming at learning RNAseq analysis on Galaxy environment.

From 29-01-2018 to 31-01-2018 at Inra, 24 ch. de Borderouge, Auzeville.

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Formation BioMAJ

From 17-12-2017 to 18-12-2017 at Vitry.

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Introduction à la Phylogénie Moléculaire : Concepts, méthodes et interprétation

Le C3BI propose des cours pour acquérir les notions théoriques de phylogénie et maitriser les outils et logiciels.

From 17-12-2017 to 21-12-2017 at Institut Pasteur.

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From RNA-Seq data to bioinformatics analysis using Nanopore sequencers

One-day workshop dedicated to transcriptome studies using the MinION

From 13-12-2017 to 13-12-2017 at 2 rue Gaston crémieux, Evry.

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Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 5/5 : Métagénomique

Formation "Métagénomique"

From 06-12-2017 to 08-12-2017 at Université de Lille.

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Formation "Plateforme MicroScope - Cours avancé"

Approfondissement des outils majeurs de la plateforme MicroScope

From 04-12-2017 to 05-12-2017 at Evry, France.

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MicroScope: formation avancée

From 03-12-2017 to 04-12-2017 at Université d'Evry Val d'Essonne.

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Cluster usage

From 03-12-2017 to 03-12-2017 at Roscoff.

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Linux advanced

From 28-11-2017 to 28-11-2017 at Roscoff.

Learn more

Linux Initiation

From 27-11-2017 to 27-11-2017 at Roscoff.

Learn more

Analyse RNA-seq de novo

From 21-11-2017 to 23-11-2017 at Villeurbanne.

Learn more

Fouille de données et analyse de données NGS avec R

From 19-11-2017 to 22-11-2017 at CBiB.

Learn more

Analyse de données RNA-seq sous l’environnement Galaxy

Acquérir les connaissances générales sur les méthodes de séquençage à haut-débit...

From 15-11-2017 to 17-11-2017 at Lyon.

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Analyse de données NGS sous Galaxy

From 14-11-2017 to 16-11-2017 at Villeurbanne.

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Ecole AVIESAN ITMO EBA

From 12-11-2017 to 16-11-2017 at Roscoff.

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How to use South Green HPC (IRD cluster)?

From 12-11-2017 to 12-11-2017 at Centre IRD Montpellier.

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6ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

From 12-11-2017 to 17-11-2017 at Roscoff.

Learn more

Aterlier de Bioinformatique (participation à)

From 11-11-2017 to 16-11-2017 at Roscoff.

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6ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

From 11-11-2017 to 11-11-2017 at Roscoff.

Learn more

Initiation à l’Analyse des données RNAseq sous l’environnement Galaxy

From 07-11-2017 to 09-11-2017 at Nantes.

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Utilisation des outils d'interprétation des données de protéomique MSDA et Proline

From 06-11-2017 to 06-11-2017 at IPHC - Strasbourg.

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Linux et script pour la bioinformatique

From 06-11-2017 to 07-11-2017 at Montpellier.

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Metagenomic amplicon analysis with stats

From 05-11-2017 to 08-11-2017 at Salle de formation Inra.

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Assemblage de génome

From 05-11-2017 to 05-11-2017 at Université Montpellier 1.

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Initiation au cloud computing

From 01-11-2017 to 01-11-2017 at Rennes.

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Annotation of transposable elements (in the frame of Genome assembly and annotation course

From 25-10-2017 to 25-10-2017 at Lisbonne (Portugal).

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Linking gene and function, comparative genomics tools for biologists

From 23-10-2017 to 25-10-2017 at Institut Pasteur.

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Analyse avancée de séquences

From 22-10-2017 to 24-10-2017 at CBiB.

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Infrastructure de calcul et analyses en bio-informatique

From 22-10-2017 to 26-10-2017 at Agrocampus Rennes.

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Introduction au logiciel R

Acquérir les compétences nécessaires à l’utilisation du logiciel R, connaître les principales analyses statistiques ...

From 18-10-2017 to 20-10-2017 at Lyon.

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Standardizing phenotyping experimental data

From 17-10-2017 to 17-10-2017 at Webinar.

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Introduction à R

From 17-10-2017 to 19-10-2017 at Villeurbanne.

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Training for Orphanet Junior Information Scientists

From 10-10-2017 to 12-10-2017 at Paris, France.

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Training for Orphanet Senior Information Scientists

From 10-10-2017 to 12-10-2017 at Paris, France.

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Training: Synteny data visualization into GnpIS

From 09-10-2017 to 09-10-2017 at Webinar.

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Phylogénie moléculaire

La plateforme ATGC organise une formation en phylogenie moleculaire a Montpellier sur 5 jours

From 09-10-2017 to 13-10-2017 at Montpellier.

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Phylogénie moléculaire

From 08-10-2017 to 12-10-2017 at Montpellier.

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How to use a bioinformatic HPC?

From 05-10-2017 to 05-10-2017 at ISRA, Dakar (Sénégal).

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Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 4/5 : Analyses de variants

Formation "Analyses de variants"

From 02-10-2017 to 04-10-2017 at Université de Lille.

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Survival Guide for Perl applied to Bioinformatics

This course provides an introduction to programming using Perl.

From 01-10-2017 to 05-10-2017 at ISRA, Bel Air, Dakar (Sénégal).

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Guide de survie à Perl pour la bioinformatique

From 01-10-2017 to 05-10-2017 at ISRA, Dakar (Sénégal).

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Administration système d'un cluster de calcul bilinformatique

From 01-10-2017 to 03-10-2017 at ISRA, Dakar (Sénégal).

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Data collection and registration of Diagnostic tests for Orphanet information scientists

From 28-09-2017 to 28-09-2017 at Paris (à distance).

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Formation "Annotation & Analyse de Génomes Procaryotes - Mise en oeuvre de la Plateforme MicroScope"

Formations dédiées à l'analyse de génomes bactériens via l'utilisation de la plate-forme MicroScope.

From 25-09-2017 to 29-09-2017 at Evry, France.

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Data collection and registration of Clinical Trials for Orphanet information scientists

From 24-09-2017 to 24-09-2017 at Paris (à distance).

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Annotation and Analysis of Procaryotic genomes using the MicroScope platform

From 24-09-2017 to 28-09-2017 at Université d'Evry Val d'Essonne.

Learn more

Data collection and registration of Research Projects for Orphanet information scientists

From 21-09-2017 to 21-09-2017 at Paris (à distance).

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Formation CeSGO

From 20-09-2017 to 20-09-2017 at Rennes.

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Data collection and registration of Patient organisations for Orphanet information scientists

From 18-09-2017 to 18-09-2017 at Paris (à distance.

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Data collection and registration of Expert Centres for Orphanet information scientists

From 14-09-2017 to 14-09-2017 at Paris (à distance).

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Introduction à Unix/Linux pour les biologistes

From 02-09-2017 to 14-10-2017 at Lyon.

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Genopole Summer School

Bioinformatic and Biostatistic tools in medical genomics

From 04-07-2017 to 07-07-2017 at Châteauform' Seine Port (77).

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Sequence analysis of amplicons from MiSeq and 454 sequencing with FROGS with Galaxy first step and statistics

Training designed to help you to deal with NGS data of 16S, 18S, DNA produced with MiSeq from Illumina and Roche 454 techno...

From 03-07-2017 to 03-07-2017 at Auzeville-Tolosane.

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Formation CeSGO

From 02-07-2017 to 02-07-2017 at Rennes.

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Metagenomic amplicon analysis with stats

From 02-07-2017 to 05-07-2017 at Salle de formation Inra.

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Module 2 : RNAseq bioinformatic from sequence to expression level smallRNA & isoform (eukaryote)

From 29-06-2017 to 29-06-2017 at Gif sur Yvette.

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Analyse avancée de séquences sur mesure

From 25-06-2017 to 26-06-2017 at BIOMNIS, Lyon.

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Annotation of transposable elements (in the frame of Genome assembly and annotation course

From 21-06-2017 to 21-06-2017 at Ljubjana (Slovenie).

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Rendre ses outils disponibles sur un cloud OpenStack

From 19-06-2017 to 19-06-2017 at IBMP (UPR2357).

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Analyse de données métagénomiques 16S

From 19-06-2017 to 22-06-2017 at Jouy en Josas.

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« STATIMAGE», Statistiques pour l’imagerie de microscopie

From 18-06-2017 to 20-06-2017 at CIEP, Sèvres.

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Formation librairie GATB

From 15-06-2017 to 15-06-2017 at Montpellier.

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Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 3/5 : Analyses ChIP-seq

Formation "Analyses ChIP-seq"

From 12-06-2017 to 13-06-2017 at Université de Lille.

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Data Analysis boot camp

This course will give participants basic skills and hands-on training in biostatistics and descriptive data analysis.

From 06-06-2017 to 15-06-2017 at Institut Pasteur.

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Python for Biology

Formantion payante du catalogue CNRS

From 06-06-2017 to 08-06-2017 at CBiB, Bordeaux.

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Training on annotation of transposable elements

From 05-06-2017 to 08-06-2017 at INRA-URGI-Versailles.

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Rrr - Rapide IntRoduction à R (R pour la génomique)

From 30-05-2017 to 01-06-2017 at ICM.

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Training on GnpIS for BreedWheat data

From 29-05-2017 to 29-05-2017 at Webinar.

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Workflow4Experimenters International Course

From 29-05-2017 to 02-06-2017 at Pasteur Institute, PARIS.

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How to use South Green HPC (IRD cluster)?

From 28-05-2017 to 28-05-2017 at IRD, Montpellier.

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Workflow4Experimenters

From 28-05-2017 to 01-06-2017 at Paris Pasteur.

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RNASeq with Galaxy

From 22-05-2017 to 23-05-2017 at Roscoff.

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Cluster - Usage

From 17-05-2017 to 17-05-2017 at Roscoff.

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Linux advanced

From 16-05-2017 to 16-05-2017 at Roscoff.

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G4I

Galaxy4Imaging : Formation à l'intégration d'outils sous Galaxy dans le domaine de l'imagerie

From 16-05-2017 to 17-05-2017 at Nantes.

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Développement d'outils galaxy pour l'imagerie

From 15-05-2017 to 16-05-2017 at Nantes.

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Linux - Initiation

From 15-05-2017 to 15-05-2017 at Roscoff.

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RNAseq alignment and transcript assemblies with statistics

From 15-05-2017 to 18-05-2017 at Salle de formation Inra.

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Atelier Inserm 246 | Gestion et réutilisation des données en santé : enjeux méthodologiques

Aperçu des outils et bonnes pratiques pour une meilleure gestion, un partage responsable et une réutilisation des données en santé

From 15-05-2017 to 17-05-2017 at Bordeaux.

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Formation MIGALE - Annotation de génomes microbiens

Module en préparation ...

From 15-05-2017 to 15-05-2017 at Jouy en Josas.

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Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 4/4 : Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Formation "Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire"

From 11-05-2017 to 12-05-2017 at Université de Lille.

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Cours MIGALE - Perl avancé

Aller plus loin avec Perl afin d’être autonome pour des manipulations complexes visant à extraire et reformater des données iss...

From 11-05-2017 to 11-05-2017 at Jouy en Josas.

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Perl avancé

From 10-05-2017 to 10-05-2017 at Jouy en Josas.

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Formation MIGALE - Initiation à Perl

Initiation à la programmation. Identifier les possibilités offertes par l’écriture de quelques lignes de code...

From 09-05-2017 to 09-05-2017 at Jouy en Josas.

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Initiation à Perl

From 08-05-2017 to 09-05-2017 at Jouy en Josas.

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Formation MIGALE - Traitements bioinfo RNA-seq

Traitement bioinformatique des données RNA-Seq

From 03-05-2017 to 03-05-2017 at Jouy en Josas.

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Traitement bioinformatique des données RNA-Seq

From 02-05-2017 to 03-05-2017 at Jouy en Josas.

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Linux et script pour la bioinformatique

From 02-05-2017 to 03-05-2017 at Montpellier.

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Annotation formelle pour la fouille de texte

From 01-05-2017 to 01-05-2017 at Jouy en Josas.

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Initiation à GO-Docker

From 17-04-2017 to 17-04-2017 at Rennes.

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Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 2/5 : Analyses RNA-seq

Formation " Analyses RNA-seq"

From 05-04-2017 to 07-04-2017 at Université de Lille.

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R - Advanced

From 04-04-2017 to 04-04-2017 at Roscoff.

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R - Initiation

From 03-04-2017 to 03-04-2017 at ROSCOFF.

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École thématique – Bioinformatics of protein-protein interactions for wet lab scientists

Bioinformatics of protein-protein interactions for wet lab scientists

From 03-04-2017 to 07-04-2017 at Institut Pasteur.

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Bioinformatics of protein--protein interactions for wet lab scientists

From 02-04-2017 to 06-04-2017 at Institut Pasteur.

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Cours MIGALE - Analyse de données métagénomiques 16S

Formation dédiée à l'analyse de données de type "métagénomique amplicon" issues des technolo-gies de séquençage 454 et Illumina.

From 27-03-2017 to 27-03-2017 at Jouy en Josas.

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Bioinformatique pour le traitement de données de séquençage (NGS)

Bioinformatics for NGS data analysis

From 27-03-2017 to 31-03-2017 at Montpellier.

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Analyse de données métagénomiques 16S

From 26-03-2017 to 29-03-2017 at Jouy en Josas.

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COURS PROGRAMMATION SCIENTIFIQUE EN PYTHON

From 26-03-2017 to 30-03-2017 at Institut Pasteur.

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Bioinformatique pour le traitement de données de séquençage (NGS)

From 26-03-2017 to 30-03-2017 at Montpellier.

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Formation MIGALE - Modélisation 3D des protéines

Analyse in silico de structures 3D de protéines. Modélisation par homologie de protéines homologues, sauvage et mutées...

From 23-03-2017 to 23-03-2017 at Jouy en Josas.

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Analyse in silico de structures 3D de protéines. Modélisation par homologie de protéines homologues, sauvage et mutées, arrimage de ligands.

From 22-03-2017 to 23-03-2017 at Jouy en Josas.

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Scientific Programming in Python

This course is intended for PhD students, engineers and research scientists willing to acquire knowledge in scientific programming

From 19-03-2017 to 30-03-2017 at Institut Pasteur.

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Ecole Thématique Internationale en Biologie des Systèmes Computationnelle

Sensibiliser les chercheurs à la richesse et à l’élégance des problématiques de biologie systémique

From 19-03-2017 to 25-03-2017 at Aussois.

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Formation MIGALE - Analyse statistique RNA-seq sous Galaxy

Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio et Galaxy)

From 16-03-2017 to 16-03-2017 at Jouy en Josas.

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Analyse statistique de données RNA-Seq - Recherche des régions d'intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio et Galaxy)

From 15-03-2017 to 16-03-2017 at Jouy en Josas.

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Analyse bioinformatique de données RNA-Seq sous Galaxy

From 14-03-2017 to 14-03-2017 at Jouy en Josas.

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Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy

Connaître les concepts et méthodes bioinformatiques utilisés pour l’analyse primaire de données issues de NGS...

From 14-03-2017 to 14-03-2017 at unité MaIAGE, Jouy-en-Josas.

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NGS sous Galaxy

From 13-03-2017 to 13-03-2017 at Jouy en Josas.

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Initiation à Galaxy

From 12-03-2017 to 12-03-2017 at Jouy en Josas.

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Annotation and Analysis of Procaryotic genomes using the MicroScope platform

From 12-03-2017 to 16-03-2017 at Faculté d'Evry Val d'Essonne.

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Formation MIGALE - Python avancé

Etre autonome pour des manipulations simples visant à extraire, reformater des données issues de fichiers texte.

From 10-03-2017 to 10-03-2017 at Jouy en Josas.

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Formation MIGALE - Initiation à Python

Initiation à la programmation. Réalisation de tâches simples d'extractions d'informations.

From 08-03-2017 to 08-03-2017 at Jouy en Josas.

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Read alignment and SNP calling

Découvrir les formats de sortie des séquenceurs nouvelle génération, les nouveaux formats d’assemblage et les biais connus ...

From 08-03-2017 to 08-03-2017 at Auzeville-Tolosane.

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Initiation à Python

From 07-03-2017 to 08-03-2017 at Jouy en Josas.

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Read alignment and small size variants calling

From 07-03-2017 to 08-03-2017 at Salle de formation Inra.

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Formation au cluster Genotoul

Cette formation explique comment on se sert du cluster et des banques de données installées sur la plate-forme.

From 07-03-2017 to 07-03-2017 at Auzeville-Tolosane.

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Formation MIGALE - Initiation à R

Initiation à R

From 07-03-2017 to 07-03-2017 at Jouy en Josas.

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Cluster

From 06-03-2017 to 06-03-2017 at Salle de formation Inra.

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Formation Genotoul Linux/Unix

Accéder à la plate‐forme, utiliser un environnement Unix, créer, manipuler et transférer des fichiers en ligne de commande ...

From 06-03-2017 to 06-03-2017 at Auzeville-Tolosane.

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Unix

From 05-03-2017 to 05-03-2017 at Salle de formation Inra.

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Rrr - Rapide IntRoduction à R (R pour la génomique)

From 05-03-2017 to 16-03-2017 at ICM.

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Initiation à R

From 04-03-2017 to 05-03-2017 at Jouy en Josas.

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Python avance

From 28-02-2017 to 28-02-2017 at Jouy en Josas.

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Phylogénie

From 23-02-2017 to 23-02-2017 at LISBP.

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TOGGLe, a workflow manager to performe large-scale NGS analysis

From 19-02-2017 to 19-02-2017 at Centre IRD Montpellier.

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Metagenomic amplicon analysis/Frogs

From 19-02-2017 to 22-02-2017 at Salle de formation Inra.

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Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 3/4 : Prédiction de gènes et annotation de protéines

Formation "Prédiction de gènes et annotation de protéines"

From 16-02-2017 to 17-02-2017 at Université de Lille.

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How to use South Green HPC (IRD cluster)?

From 07-02-2017 to 07-02-2017 at Centre IRD Montpellier.

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Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 1/5 : Analyses ADN

Formation "Analyses ADN"

From 06-02-2017 to 07-02-2017 at Université de Lille.

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European Galaxy Developer Workshop

European edition of the Galaxy for Bioinformatics Workshop

From 16-01-2017 to 19-01-2017 at Strasbourg, France.

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European Galaxy Developer Workshop

From 15-01-2017 to 18-01-2017 at Strasbourg.

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Workflow4Metabolomics 2016

Using Galaxy and the Workflow4metabolomics infrastructureto analyse metabolomics data

From 28-11-2016 to 02-12-2016 at Roscoff, France.

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Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 2/4 : Alignement de séquences

Formation "Alignement de séquences"

From 24-11-2016 to 25-11-2016 at Université de Lille.

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Journées SUCCES 2016

Présenter des travaux scientifiques, dans toutes les disciplines, réalisés grâce à des infrastructures de grilles de calc...

From 23-11-2016 to 24-11-2016 at Institut de Physique du Globe, Paris.

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Détection et Annotation des éléments transposables dans les génomes eucaryotes

Formation sur la détection et l'annotation des éléments transposables

From 20-11-2016 to 22-11-2016 at INRA-URGI, Centre de Versailles.

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5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

From 20-11-2016 to 25-11-2016 at Roscoff.

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Analyse de données RNA-seq sous Galaxy

Séquençage haut débit, analyse du transcriptome, navigateur de génome...

From 15-11-2016 to 16-11-2016 at PRABI-Doua, Villeurbanne.

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Introduction à la Phylogénie Moléculaire : CONCEPTS, METHODES ET OUTILS

Le C3BI propose des cours pour acquérir les notions théoriques de phylogénie et maitriser les outils et logiciels.

From 13-11-2016 to 24-11-2016 at Institut Pasteur 25-28 rue du Dr Roux 75015 Paris.

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Making efficient NGS data analysis softwares

GATB devel day: learn the basics of the high-performance NGS data processing GATB-Core library

From 09-11-2016 to 09-11-2016 at Institut Henri Poincaré, Paris, France.

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Initiation à Galaxy

Formation "Initiation à Galaxy"

From 07-11-2016 to 07-11-2016 at Université de Lille.

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Formations Cloud IFB IBI-2

Utilisation avancée du cloud IFB

From 19-10-2016 to 19-10-2016 at IFB, Gif-sur-Yvette.

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Galaxy4Bioinformatics

Formation aux bonnes pratiques d'intégration d'outils sous Galaxy

From 18-10-2016 to 20-10-2016 at Lyon.

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Formations Cloud IFB IBI-1

Formation sur l'utilisation de base du cloud IFB

From 18-10-2016 to 18-10-2016 at IFB, Gif-sur-Yvette.

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Formation à R

Principales analyses statistiques sous R, graphiques, librairies de biologie...

From 12-10-2016 to 14-10-2016 at PRABI-Doua, Villeurbanne.

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Metagenomics: amplicon analysis under Galaxy

Use our Galaxy instance, clean reads, clusterize them, do the taxonomic affiliation and perform statistics to interpret results

From 10-10-2016 to 13-10-2016 at INRA Auzeville, France.

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Phylogénie moléculaire

La plateforme ATGC organise une formation en phylogenie moleculaire a Montpellier sur 5 jours

From 09-10-2016 to 13-10-2016 at Montpellier.

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Summer School 2016 in Metagenomics

From 12-09-2016 to 16-09-2016 at Paris.

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Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 1/4 : Banques de données et Blast

Formation "Banques de données et BLAST"

From 07-09-2016 to 08-09-2016 at Université de Lille.

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Formations Cloud IFB IBI-3

Développement de machines virtuelles modèles (appliances)

From 13-07-2016 to 13-07-2016 at IFB-Core, Gif sur Yvette.

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Intégration d'outils dans Galaxy

Workshop organisé sur les bonnes pratiques d'intégration, dans Galaxy, des outils disponibles dans le toolshed.

From 24-05-2016 to 24-05-2016 at Clermont-Ferrand - Université d'Auvergne.

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Galaxy : alignment and variant calling

Formats de fichiers, alignements des reads sur un génome de référence et de detection de SNP et petits indels via GATK

From 18-05-2016 to 19-05-2016 at INRA de Toulouse/Auzeville.

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Galaxy First Step

Initiation à l'environnement Galaxy, prise en main de l'instance toulousaine et apprentissage des bonnes pratiques d'utilisation.

From 17-05-2016 to 17-05-2016 at INRA de Toulouse/Auzeville.

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Génomique / Bioinformatique « 2 en 1 »

RNA-Seq

From 22-04-2016 to 22-04-2016 at Bordeaux.

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IFB Cloud training

Training courses on the IFB Cloud organised in 3 modules (IBI), one per day.

From 19-04-2016 to 19-04-2016 at Gif sur Yvette.

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France Genomics Training

Training Cloud & Galaxy from IFB to France Genomics

From 29-02-2016 to 03-03-2016 at Gif sur Yvette.

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