
Training type:
Formation professionnelle
Description:
Objectifs
Connaître les bases de la modélisation moléculaire : modélisation par homologie, arrimage (docking) de ligands, mutations in silico. Une demi-journée dédiée à la modélisation de vos protéines d'intérêts.
Programme
- Visualiser : Connaître les bases de la visualisation des protéines en 3D avec PYmol.
- Comprendre : Analyse des structures 3D de protéines (RX ou RMN). Recherche d'homologues avec HHpred, I-Tasser, etc... Modélisation par homologie avec Modeller, Phyre2. Principes et applications.
- Prédire : Docking de ligands avec Autodock. Prédiction des mutations in silico. Principes et applications.
- L'accent sera mis sur les points forts et les limites des différents outils et la pratique avec de nombreux "hand- on tutorials"
- Plus une session dédiée : «bring your own protein».
People trained:
7/ an
Training duration:
2 jours / an
Requirements:
Ce cycle est ouvert à l'ensemble des agents de l'INRA et aux extérieurs.
Session number:
1
recurrency:
Oui
Lien vers la formation:
Date de la session:
Thursday, March 23, 2017 (All day)
Lieu de la formation:
Jouy en josas
Cours résumé:
Analyse in silico de structures 3D de protéines. Modélisation par homologie de protéines homologues, sauvage et mutées...
Thème (formations professionnelles uniquement):