PRABI-HCL

Adress
Faculté de Médecine Lyon Sud
165 chemin du Grand Revoyet 69310 Pierre Bénite
Structure(s)
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Unit:
LBBE, UMR5558
[field_pole_regional_de_rattachem]
Scientific leader(s)
Scientific leader
Not documented
Technical leader(s)
Technical leader
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Certificat(s)
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Domains of activity
  • Biology
  • Biomedical
  • Biotechnology
Keywords:
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Formation professionnelle

Trainees:
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Training time:
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No upcoming session scheduled

Analyse de données génomiques et post-­‐génomiques

Description

Formation annuelle  des  Hospices  Civils  de  Lyon,  organisée  par  l’EBS/SB-­HCL/PRABI sur deux jours, en partenariat avec la  plateforme de protéomique de Dijon.

Access conditions
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Formation universitaire

Trainees:
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Training time:
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No upcoming session scheduled

Licence Professionnelle de Biotechnologies spécialité génomique

Description

Intervention sous la responsabillté du Pr Joël Lachuer

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Trainees:
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Training time:
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Introduction à l’analyse des données de grande dimension

Description

Cours d’introduction à l’analyse des données de grande dimension dans le cadre de l’enseignement de Biomédecine quantitative en 3ème année de médecine (responsable Pr Pascal Roy).

Access conditions
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Trainees:
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Training time:
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No upcoming session scheduled

M2 « BioStatistique, BioInformatique, BioMathématique en Santé (B3S) »

Description

DU master de Santé Publique (responsables Pr Pascal Roy, Dr Delphine Maucort-­‐Boulch)

Access conditions
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Trainees:
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Training time:
Not documented
No upcoming session scheduled

M2 « Technologies à Haut Débit en Cancérologie »

Description

 DU master de Cancérologie (Responsable Dr Claire Bardel)

Access conditions
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Internal publications

Truntzer C, Mercier C, Esteve J, Gautier C, Roy P. Importance of data structure in comparing two dimension reduction methods for classification of microarray gene expression data. BMC bioinformatics 2007; 8: 90.


Truntzer C, Maucort-­Boulch D, Roy P. Comparative optimism in models involving both classical clinical and gene expression information. BMC Bioinformatics 2008;9: 434.


Mercier C, Truntzer C, Pecqueur D, Gimeno JP, Belz G, Roy P. Mixed-­‐model of ANOVA for measurement reproducibility in proteomics. Journal of proteomics 2009;72:974-­‐981.


Roy P, Truntzer C, Maucort-­Boulch D, Jouve T, Molinari N. Protein mass spectra data analysis for clinical biomarker discovery: a global review. Briefings in  Bioinformatics
2011;12:176-­‐186.


Trouillas  J,  Roy  P,  Sturm  N,  Dantony  E,  Cortet-­‐Rudelli  C,  Viennet  G,  Bonneville  JF, Assaker R, Auger C, Brue T, Cornelius A, Dufour H, Jouanneau E, Francois P, Galland F, Mougel F, Chapuis F, Villeneuve L, Maurage CA, Figarella-­‐Branger D, Raverot G. A  new prognostic clinicopathological classification of pituitary adenomas: a multicentric case-­control    study    of    410    patients    with    8    years    post-­‐operative    follow-­‐up.    Acta Neuropathologica  2013;126:123-­‐35.


Truntzer  C,  Maucort-­Boulch  D,  Roy  P.  Impact  of  the  selection  mechanism  in  the identification  and  validation  of  new  ``omic''  biomarkers.  Journal  of   Proteomics   & Bioinformatics 2013; 6:164-­‐170.


Jouve T, Maucort-­‐Boulch D, Ducoroy P, Roy P. Statistical power in mass  spectrometry proteomic studies? Soumis au Journal of Mass Spectrometry (soumis à publication)


Gerfault L, Klich A, Mercier C, Roy P, Giovannelli JF, Giremus A, Mahé P, Charrier B, Lacroix B, Grangeat P. Statistical analysis of Bayesian hierarchical inversion for MRM protein quantification and QDA serum sample classification. ASM (American Solciety for Mass Spectrometry). Baltimore, Maryland, USA, 15/06/2014 -­‐ 19/06/2014.


Dridi N, Giremus A, Giovannelli JF, Truntzer C, Roy P, Gerfaut L, Charrier JP, Ducoroy P, Mercier   C,   Grangeat.   Variable   selection   for   noisy   data   applied   in   proteomics. ICASSP  IEE  International  Conference  of  Acostics,  Speech,  and  Signal  Proceeding. Florence, Italie, 04/05/2014 -­‐ 09/05/2014.


Roy P. Erreur Technique, Variabilité Biologique et Identification de Biomarqueurs en protéomique. EUDIPHARM. Lyon, France, 12/05/2014 -­‐ 13/05/2014.


Gerfault  L,  Szacherski  P,  Giovannelli  JF,  Giremus  A,  Mahé  P,  Fortin  T,   Choquet-­‐ Kastylevsky G, Klich A, Mercier C, Roy P, Salvador A, Lemoine J, Charrier JP, Lacroix B, Grangeat  P.  Assessing  MRM  protein  quantification  and  serum  sample  classification performances  of  a  Bayesian  Hierarchical  Inversion  method  on  a  colorectal  cancer cohort.   EuPA   (Conference   European   Proteomic   Association).   Saint-­‐Malo,   France,
14/10/2013 -­‐ 17/10/2013.


Szacherski  P,  Gerfault  L,  Giovannelli  JF,  Giremus  A,  Mahé  P,  Fortin  T,   Choquet-­‐ Kastylevsky G, Klich A, Mercier C, Roy P, Salvador A, Lemoine J, Charrier JP, Lacroix B, Grangeat  P.  MRM  protein  quantification  and  serum  sample  classification.  61th  ASM (Mass  Spectometry  and  Allied  Topics).  Minneapolis,  Minnesota,  USA,  09/06/2013  -­‐
13/06/2013.


Klich  A, Mercier  C, Grangeat P, Gerfault L, Charrier JP, Maucort-­Boulch  D, Roy  P. Analyse statistique des performances des méthodes de quantification proétique. Ateliers PROSPECTOM. Grenoble, France, 29/11/2012 -­‐ 30/11/2012.


Roy P. Identification et validation de biomarqueurs en cancérologie. EDF -­‐  Séminaire d’Epidémiologie. Séminaire : Priorités et orientations sur les soutiens  d’EDF dans le domaine de l’épidémiologie Paris, France, 17/09/2012 -­‐ 17/09/2012.


Roy P, Truntzer C, Maucort-­Boulch D . Intégration de données multiples générées par les  techniques  à  haut  débit    (séquençage,  CGH,  SNP,  transcriptome…).  Journées  de Statisticiens des CLCCC (Centre de Lutte Contre le Cancer). Institut de Formation OscarLambret. Lille, France, 16/06/2011 -­‐ 17/06/2011.


Rosille D, Cahu X, Pangault C, de Vos J, Maucort-­Boulch D, Roy P, Sémana G, Le Gouill D, Damotte D, Lamy T, Milpied N, Fest T, Burgun A, Semana G. Etude del l’expression et de la régulation du récepteur CXCR4 dans les cellules tumorales de lymphome folliculaire. Congrès  de  la  Société  Française  d’Hématologie  (SFH).  Paris,  France,  10/03/2011  -­‐
11/03/2011.


Roy P, Truntzer C, Maucort-­Boulch D. Intégration de données multiples générées par les techniques de haut débit. Congrès de la Société Française d’Hématologie (SFH). Paris, France, 10/03/2011 -­‐ 11/03/2011.


Roy P. Complex   modelling   and   systems   biology   for   biomarker   development. EUDIPHARM. Orateur invité Bruxelles, Belgique, 22/09/2011 -­‐ 23/09/2011.


Naudet B, Maucort-­Boulch D, Sanlaville D, Labalme A and Roy P. Impact of noise on the  detection  of  chromosomal  abnormalities  in  array  CGH  measurements.   4ème Conférence d’Epidémiologie Clinique (EPICLIN) et XVème Réunion des Statisticiens des Centres de Luttes contre le Cancer. Paris, France, 26/05/2010 -­‐ 28/05/2010.

External publications
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