bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et doctorants en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.
Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours:
- Banques de données et BLAST
- Alignement de séquences
- Prédiction de gènes et annotation de protéines
- Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire
Ces modules peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.
Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de bilille.
Les objectifs du module 3 sont :
- découvrir les logiciels liés à la prédiction de gènes et à l'annotation de protéines
- acquérir la méthodologie pour prédire les gènes présents sur un génome qu'il soit bactérien ou eucaryote
- acquérir la méthodologie pour analyser la séquence protéique prédite et en déduire la fonction possible de la protéine, avoir une idée de sa localisation cellulaire et de sa structure
- être capable d'analyser les résultats obtenus par les logiciels avec un regard critique
Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Sylvain Legrand (mails)
- Savoir utiliser un ordinateur (Windows...) : naviguer sur internet (Internet Explorer ou Firefox), utiliser un traitement de texte (Word ou OpenOffice).
- Être familié avec les banques de données, Blast, formats de séquences et alignements de séquences (idéalement avoir suivi le module 1/4 « Banques de données et Blast » et le module 2/4 « Alignements de séquences » du cycle d'initiation à la bioinformatique).
