Le séquençage à haut débit n’a pas seulement accéléré les projets de séquençage des espèces, mais a influencé beaucoup de domaines tels que par exemple médecine personnalisée, sélection d’espèces d’intérêt agronomique et a changé profondément la façon de concevoir la recherche en génomique.
Objectif :
Le but de ces ateliers est de permettre d’appréhender les projets scientifiques ayant trait au séquençage de façon globale allant de la production de données à leur analyse. Ils concernent aussi bien les chercheurs, les personnels techniques que les étudiants présents dans les laboratoires.
Les ateliers vont vous permettre de :
· Connaître les principales méthodes de préparation de librairies, leurs avantages et leurs inconvénients
· Connaître les spécificités des différentes technologies de séquençage et savoir laquelle est le mieux adapté à vos besoins
· Savoir choisir le nombre d’échantillons, la profondeur et la qualité de séquençage
· Connaître les éléments permettant de planifier une expérience NGS
· Comprendre le principe des méthodes d’analyse des données de NGS et savoir laquelle va pouvoir répondre à vos besoins et correspond à vos données
· Connaitre les différentes étapes de ces méthodes
· Connaitre les limites d’analyse : que puis-je obtenir en fonction de mes données ? A quelle question biologique pourrais-je répondre en fonction des méthodes bioinformatiques et des caractéristiques des données obtenues
Les ateliers Génomique / Bioinformatique « 2 en 1 » traiterons de 4 sujets :
- RNA-Seq, 22 avril 2016
- Génome complet, 3 Mai 2016
- Exomes et panels de gènes, Mi-Juin 2016
- Métagénomique, Septembre 2016
Nous vous invitons à vous inscrire aux deux premiers ateliers, l’inscription pour les deux derniers sera ouverte dès la détermination des dates. L’inscription est gratuite mais obligatoire :
- 22 Avril RNA-Seq : http://goo.gl/forms/e3ltJ8S02I
- 3 Mai : Génome complet : http://goo.gl/forms/bnLXtYVVul
Lieu :
Ces Ateliers ont lieu dans la salle de conference du Centre de Génomique Fonctionnelle Bordeaux – Université de Bordeaux – site Carreire http://www.cgfb.u-bordeaux2.fr/fr/contact-plan-d-acces
Organisation / Contact :
Les Ateliers Génomique – Bioinformatique « 2 en 1 » sont une initiative de l’Action Transversale G2P du Département Science de la Vie de l’Université de Bordeaux, de l’Institut Français de Bioinformatique et de France Génomique.
Pour plus d’information vous pouvez prendre contact avec Alexis Groppi (alexis.groppi@u-bordeaux.fr) et Macha Nikolski (macha@labri.fr)
