L’INRA (unité Ingenum), le PEPI MACS (Mathématiques Appliquées - Calcul Scientifique) et le Groupe de Travail Galaxy de l'Institut Français de Bio-informatique proposent une formation pour l'intégration d'outils sous Galaxy. Cette formation s’adresse principalement aux ingénieurs travaillant dans les domaines autour de l’imagerie : traitement d’images, phénotypage, reconnaissance de formes, histologie quantitative, etc.
Une première journée de cours présentera les bonnes pratiques d’intégration. La seconde journée sera consacrée à l’intégration de ses outils sous Galaxy. A partir des outils à intégrer chaque participant sera en mesure de construire un/des workflows sous Galaxy.
Lieu : Nantes (Hôtel Westotel)
Date : 16 au 17 mai 2017 (Accueil possible dès le lundi 15 mai 19H00)
Pré-requis : connaissance du langage XML, bonne pratique de la ligne de commande sous Linux, connaissance d'un langage de scripting
Frais d'inscription (ces frais couvrent l'hébergement, la restauration et les frais pédagogiques) :
- INRA : 150 € HT
- Académiques : 250 € HT
- Industriels : 500 € HT
Logistique : Les participants utiliseront leur PC portable. Configuration conseillée : processeur supportant la virtualisation, 8 Go RAM, 30 Go d'espace disque
Nombre de participants : 12 max.
Intervenants :
Eric Biot, Anthony Bretaudeau, Christophe Caron, Olivier Inizan, Valentin Marcon
Comité d'organisation :
Eric Biot, Christophe Caron, Olivier Inizan, David Legland, Nicolas Parisey
