Formation Cloud et Galaxy IFB pour France Génomique
Le Groupe de Travail Galaxy et la cellule e-Infrastructure de l’IFB ont élaboré une formation qui a pour objectif de former des ingénieurs bio-informaticiens aux bonnes pratiques d'intégration d'outils sous Galaxy et dans le cloud IFB. Cette formation reprend en bonne partie les modules présentés lors des écoles G4B, et la partie cloud correspond aux trois modules du cursus de formation "Cloud IFB pour les Sciences du Vivant » (http://www.france-bioinformatique.fr/fr/evenements/IFB-IBI).
Elle s’articule autour de plusieurs ateliers :
• Bonnes pratiques de développements et d’intégration d'outils ;
• Concept et présentation du "Toolshed" (entrepôt d'outils Galaxy) ;
* Déploiement sur une instance de production
* Utilisation de base du cloud IFB (IBI-1)
* Utilisation avancée du cloud IFB (IBI-2).
* Développement de machines virtuelles modèles (appliances), cas d'usage avec les outils intégrés dans Galaxy au cours des sessions précédentes.(IBI-3)
La session autour de Galaxy sera suivie du cursus de formation "Cloud IFB pour les Sciences du Vivant ».
Les outils intégrés sous Galaxy dans la première session pourront ainsi être déployés dans l’instance Galaxy du cloud IFB lors d’une session pratique.