France Genomics Training
Training Cloud & Galaxy from IFB to France Genomics
Du 29-02-2016 au 03-03-2016 à Gif sur Yvette
Date limite d'inscription: Aucune information

Formation Cloud et Galaxy IFB pour France Génomique

Le Groupe de Travail Galaxy et la cellule e-Infrastructure de l’IFB ont élaboré une formation  qui a pour objectif de former des ingénieurs bio-informaticiens aux bonnes pratiques d'intégration d'outils sous Galaxy et dans le cloud IFB. Cette formation reprend en bonne partie les modules présentés lors des écoles G4B, et la partie cloud correspond aux trois modules du cursus de formation "Cloud IFB pour les Sciences du Vivant » (http://www.france-bioinformatique.fr/fr/evenements/IFB-IBI).

Elle s’articule autour de plusieurs ateliers :

        • Bonnes pratiques de développements et d’intégration d'outils ;
        • Concept et présentation du "Toolshed" (entrepôt d'outils Galaxy) ;
        * Déploiement sur une instance de production
        * Utilisation de base du cloud IFB (IBI-1)
        * Utilisation avancée du cloud IFB (IBI-2).
        * Développement de machines virtuelles modèles (appliances), cas d'usage avec les outils intégrés dans Galaxy au cours des sessions précédentes.(IBI-3)

La session autour de Galaxy  sera suivie du cursus de formation "Cloud IFB pour les Sciences du Vivant ».
Les outils intégrés sous Galaxy dans la première session pourront ainsi être déployés dans l’instance Galaxy du cloud IFB lors d’une session pratique.


Programme

Programme préliminaire 

L’inscription aux deux sessions, bien qu’indépendante est fortement recommandée. Le nombre de places étant limité, priorité sera donnée aux personnels des plateformes FG en charge des developpements bioinformatiques.

L'école est gratuite, mais les frais de mission et d'hebergement sont à la charge des participants.

Date limite d’inscription le 12 février.

 

Intervenants:

  • Migale (INRA, Jouy en Josas)
  • URGI (INRA, Versailles)
  • Institut Curie
  • Roscoff
  • Institut Pasteur
  • IFB-core

 

Informations Pratiques

Le Complexe d'accueil vous propose des chambres d'hôtes conviviales et dans les forfaits de déplacement. Plus d'infos...


Les incriptions sont closes depuis le 12 février 2016.


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